258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5250 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 596 aa  1231    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  44.71 
 
 		 581 aa  545  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  45.47 
 
 		 589 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  45.47 
 
 		 589 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  40.66 
 
 		 596 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  40.51 
 
 		 576 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  39.79 
 
 		 596 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  43.63 
 
 		 574 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  40.43 
 
 		 598 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  38.5 
 
 		 595 aa  427  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  39.82 
 
 		 565 aa  420  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  36.66 
 
 		 604 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  36.24 
 
 		 599 aa  374  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0896  Rhs element Vgr protein  29.24 
 
 		 545 aa  244  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.79786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1040  Rhs element Vgr protein  29.24 
 
 		 545 aa  244  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.605907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  28.55 
 
 		 593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  29.53 
 
 		 589 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  27 
 
 		 641 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  25.1 
 
 		 592 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  28.13 
 
 		 610 aa  140  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  25.81 
 
 		 578 aa  135  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  23.76 
 
 		 602 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  31.55 
 
 		 229 aa  103  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  24.47 
 
 		 606 aa  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  25.4 
 
 		 587 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  26.23 
 
 		 594 aa  97.4  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  33.03 
 
 		 218 aa  94.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  29.96 
 
 		 248 aa  92.8  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  24.7 
 
 		 599 aa  92.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4109  Rhs element Vgr protein  23.22 
 
 		 576 aa  90.5  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0273732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  30.77 
 
 		 247 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  24.17 
 
 		 605 aa  87.8  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  30.32 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  32.83 
 
 		 616 aa  80.5  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  23.53 
 
 		 619 aa  77.4  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1508  phage protein D  23.85 
 
 		 348 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  23.36 
 
 		 589 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  28.14 
 
 		 599 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  23.16 
 
 		 652 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  23.21 
 
 		 617 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0770  Phage protein D-like protein  23.96 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.737587  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  25.73 
 
 		 275 aa  70.1  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1564  hypothetical protein  22.78 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  26.05 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  22.83 
 
 		 602 aa  67.4  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  25.52 
 
 		 642 aa  67  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  24.08 
 
 		 615 aa  67  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  22.3 
 
 		 723 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  30.59 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3220  Rhs element Vgr protein  22.37 
 
 		 618 aa  63.9  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4348  hypothetical protein  33.09 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0387743  normal  0.103118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3664  hypothetical protein  25.33 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000879822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0982  hypothetical protein  22.59 
 
 		 362 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  25.28 
 
 		 641 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4015  Rhs element Vgr protein  29.8 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211679  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2892  hypothetical protein  26.97 
 
 		 499 aa  62  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  22.58 
 
 		 612 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  28.45 
 
 		 611 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  25.7 
 
 		 697 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  24.9 
 
 		 1017 aa  58.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  23.75 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  27.07 
 
 		 753 aa  57.4  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  25.98 
 
 		 782 aa  57.4  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  25.98 
 
 		 782 aa  57.4  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  25.98 
 
 		 644 aa  57  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  23.88 
 
 		 694 aa  56.6  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  23.11 
 
 		 706 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  24.19 
 
 		 646 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  24.83 
 
 		 614 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  28.31 
 
 		 1003 aa  54.7  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  23.39 
 
 		 643 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3043  type VI secretion system Vgr family protein  25.32 
 
 		 611 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  23.89 
 
 		 618 aa  54.3  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  27.6 
 
 		 835 aa  54.3  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  27.72 
 
 		 675 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  24.1 
 
 		 763 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  22.41 
 
 		 709 aa  53.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  24.1 
 
 		 763 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  25.32 
 
 		 645 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  24.1 
 
 		 763 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  28.32 
 
 		 769 aa  52  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  21.39 
 
 		 687 aa  52  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  21.39 
 
 		 687 aa  52  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  21.39 
 
 		 687 aa  52  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  24.56 
 
 		 1095 aa  52  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  28.85 
 
 		 735 aa  52  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  23.93 
 
 		 633 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  33.67 
 
 		 678 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1894  Rhs element Vgr protein  23.08 
 
 		 763 aa  51.6  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  23.93 
 
 		 633 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  26.2 
 
 		 616 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  30.07 
 
 		 741 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  23.93 
 
 		 633 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  23.93 
 
 		 633 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  32.1 
 
 		 785 aa  51.2  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0797  Rhs element Vgr protein  23.76 
 
 		 762 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0709  Rhs element Vgr protein  23.76 
 
 		 762 aa  51.2  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.730029  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  35 
 
 		 655 aa  50.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 702 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  30.63 
 
 		 792 aa  50.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>