More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1447 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1447  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
271 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  23.49 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5612  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
311 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00676484  hitchhiker  0.00203627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  25.84 
 
 
397 aa  89.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  40.74 
 
 
288 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  24.64 
 
 
303 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3470  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304783  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2496  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.81 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0929  alpha/beta hydrolase fold  28.45 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.345522  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  21.98 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 
425 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.24 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.75 
 
 
265 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3549  HOMODA hydrolase (CmtE)  35.96 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  24.18 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  32.23 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
277 aa  72  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
322 aa  72  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 
297 aa  72  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
252 aa  72  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3133  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
269 aa  72  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
253 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
277 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  23.98 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  22.34 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.34 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.09 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  24.39 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  25.85 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  25.85 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  21.98 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  35.45 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1575  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  22.47 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.62 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  31.86 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  33.07 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  34.95 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
290 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.89 
 
 
371 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  20.89 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.89 
 
 
371 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  34.58 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.97 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.77 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  31.67 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.91 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.08 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  26.72 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>