More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0679 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0679  E1-E2 ATPase-associated domain protein  100 
 
 
797 aa  1651    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203098  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2482  Copper-exporting ATPase  45.21 
 
 
799 aa  714    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.113169  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5325  Copper-exporting ATPase  44.63 
 
 
823 aa  694    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3569  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  44.17 
 
 
804 aa  681    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.532443 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2536  copper-exporting ATPase  45.06 
 
 
795 aa  710    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1133  Cu(I)-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
799 aa  650    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710134  normal  0.817689 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  29.56 
 
 
791 aa  356  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  30.73 
 
 
796 aa  353  5.9999999999999994e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  28.48 
 
 
790 aa  332  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  28.21 
 
 
807 aa  325  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  29.57 
 
 
794 aa  325  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  28.5 
 
 
826 aa  323  6e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  29.54 
 
 
799 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  29.54 
 
 
799 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  29.43 
 
 
799 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  27.37 
 
 
787 aa  313  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  27.82 
 
 
806 aa  311  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  29.41 
 
 
799 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  28.12 
 
 
787 aa  310  5e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  28.89 
 
 
815 aa  310  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  29.56 
 
 
803 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  29.29 
 
 
799 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  29.1 
 
 
819 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  29.45 
 
 
799 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  28.77 
 
 
792 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  29.06 
 
 
803 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  28.73 
 
 
797 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  29 
 
 
799 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  29.3 
 
 
795 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  26.81 
 
 
817 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  28.81 
 
 
803 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  29.68 
 
 
792 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  29.55 
 
 
794 aa  302  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  29.15 
 
 
793 aa  302  1e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  28.75 
 
 
812 aa  301  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  28.11 
 
 
797 aa  295  2e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  31.44 
 
 
729 aa  295  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  26.81 
 
 
820 aa  295  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  27.59 
 
 
846 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  26.96 
 
 
806 aa  293  9e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  26.3 
 
 
791 aa  291  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  28.16 
 
 
792 aa  291  4e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  27.58 
 
 
808 aa  290  6e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  27.32 
 
 
813 aa  290  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  27.85 
 
 
834 aa  289  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  27.84 
 
 
818 aa  289  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0573  heavy metal translocating P-type ATPase  28.5 
 
 
783 aa  289  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.113758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  28.11 
 
 
800 aa  288  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  27.28 
 
 
849 aa  288  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  27.59 
 
 
814 aa  287  5e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  25.89 
 
 
851 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  28 
 
 
882 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  26.19 
 
 
847 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  31.23 
 
 
727 aa  282  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  27.92 
 
 
824 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  27.41 
 
 
839 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  26.19 
 
 
847 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  28.21 
 
 
783 aa  279  1e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0472  heavy metal translocating P-type ATPase  27.02 
 
 
781 aa  279  1e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  28.32 
 
 
814 aa  280  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  28.21 
 
 
824 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  30.15 
 
 
746 aa  276  7e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1291  heavy metal translocating P-type ATPase  28.09 
 
 
783 aa  276  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  27.25 
 
 
828 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  28.88 
 
 
811 aa  276  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  27.5 
 
 
806 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  26.76 
 
 
838 aa  275  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  27.76 
 
 
861 aa  275  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  27.79 
 
 
823 aa  272  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  28.01 
 
 
824 aa  272  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  27.43 
 
 
806 aa  272  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  26.72 
 
 
811 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  29.54 
 
 
724 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  29.08 
 
 
755 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  29.93 
 
 
732 aa  271  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  28.34 
 
 
762 aa  271  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  27.15 
 
 
816 aa  266  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  26.47 
 
 
811 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  26.47 
 
 
802 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  31.06 
 
 
737 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  27.53 
 
 
807 aa  266  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  28.65 
 
 
743 aa  266  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  31.57 
 
 
737 aa  263  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  28.55 
 
 
809 aa  263  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  29.66 
 
 
765 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  27.78 
 
 
810 aa  259  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  28.27 
 
 
728 aa  259  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  30.96 
 
 
737 aa  259  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  27.4 
 
 
752 aa  258  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  28.9 
 
 
777 aa  257  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  25.88 
 
 
802 aa  256  9e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  29.27 
 
 
738 aa  253  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  29.55 
 
 
731 aa  253  7e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  27.64 
 
 
752 aa  248  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  29.6 
 
 
760 aa  248  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  27.35 
 
 
824 aa  245  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  25.35 
 
 
789 aa  246  1.9999999999999999e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  27.37 
 
 
758 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  29.37 
 
 
805 aa  243  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  25.25 
 
 
807 aa  243  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>