101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2870 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  578  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.82 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  58.82 
 
 		 137 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  56.62 
 
 		 138 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.88 
 
 		 138 aa  156  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.88 
 
 		 144 aa  152  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.26 
 
 		 138 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.17 
 
 		 137 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.06 
 
 		 137 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  46.43 
 
 		 145 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  48.92 
 
 		 140 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.37 
 
 		 137 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.15 
 
 		 137 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  44.2 
 
 		 146 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  50.37 
 
 		 145 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.43 
 
 		 141 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  44.03 
 
 		 144 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  42.14 
 
 		 143 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.19 
 
 		 145 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  48.51 
 
 		 144 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  45.99 
 
 		 142 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.06 
 
 		 137 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  45.99 
 
 		 141 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  45.99 
 
 		 142 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.36 
 
 		 145 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.43 
 
 		 143 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.26 
 
 		 137 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  45.65 
 
 		 146 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  39.86 
 
 		 145 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  41.18 
 
 		 145 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.78 
 
 		 145 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  41.48 
 
 		 145 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.48 
 
 		 145 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  44.44 
 
 		 153 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.17 
 
 		 145 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  41.04 
 
 		 139 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  45.95 
 
 		 145 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.12 
 
 		 146 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  44.07 
 
 		 143 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  44.07 
 
 		 143 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  44.07 
 
 		 143 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  43.48 
 
 		 142 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  43.48 
 
 		 142 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  44.07 
 
 		 145 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  41.53 
 
 		 142 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  40.56 
 
 		 142 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  41.53 
 
 		 142 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  42.75 
 
 		 142 aa  99.4  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.04 
 
 		 143 aa  99.8  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 142 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  41.13 
 
 		 142 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  40.32 
 
 		 142 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  40.32 
 
 		 142 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  40.32 
 
 		 142 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  40.32 
 
 		 142 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  40.32 
 
 		 142 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  40.32 
 
 		 142 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  40.32 
 
 		 142 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  37.19 
 
 		 142 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  37.19 
 
 		 142 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  45.24 
 
 		 141 aa  85.9  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  37.19 
 
 		 142 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 		 142 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.33 
 
 		 142 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  30.08 
 
 		 147 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  23.4 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  25.21 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0229  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.52 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  22.07 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3977  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.33 
 
 		 144 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000701151  hitchhiker  0.00000000199518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  21.77 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.65 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  22 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  22 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0576  hypothetical protein  23.89 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.726125  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  22 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  21.57 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  25.69 
 
 		 249 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  25.69 
 
 		 249 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  22.9 
 
 		 290 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  31.69 
 
 		 159 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.09 
 
 		 137 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  24.15 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  22.52 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1376  hypothetical protein  24.77 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0433  hypothetical protein  25.35 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0468  hypothetical protein  25.35 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.784774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  22.03 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  28.21 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0999  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 143 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  25.84 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  28.95 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  22.27 
 
 		 273 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  22.27 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.43 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  26.88 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.07 
 
 		 139 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  22.75 
 
 		 281 aa  42.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>