More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2384 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  100 
 
 		 364 aa  734    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  30.49 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0724  NLP/P60 protein  49.56 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  29.63 
 
 		 536 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  34.2 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  42.03 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  29.5 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  30.22 
 
 		 298 aa  99.8  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  44.33 
 
 		 207 aa  99.8  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 307 aa  99.4  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  38.66 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  37.82 
 
 		 278 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  40.91 
 
 		 269 aa  96.7  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  31.93 
 
 		 424 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  45.36 
 
 		 188 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  25.91 
 
 		 532 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  35 
 
 		 284 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  38.83 
 
 		 267 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  43.12 
 
 		 205 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 183 aa  93.6  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 208 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  41.24 
 
 		 207 aa  93.2  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 208 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  43.97 
 
 		 231 aa  92.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  48.65 
 
 		 150 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  45.83 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  25.83 
 
 		 532 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  47.25 
 
 		 208 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  47.25 
 
 		 207 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  44.79 
 
 		 214 aa  89  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  44.17 
 
 		 150 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  40.83 
 
 		 181 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  40.35 
 
 		 221 aa  88.2  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  37.04 
 
 		 214 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  42.06 
 
 		 265 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  31.53 
 
 		 370 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  39.81 
 
 		 169 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  25.47 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  34.75 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  36.51 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  38.39 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  34.22 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  37.61 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  34.75 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  36.04 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  38.68 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  34.85 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  32.64 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  37.61 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  34.85 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  33.85 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  34.11 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  26.53 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0941  NLP/P60 family protein  35.65 
 
 		 159 aa  82  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.33367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  34.88 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  37.61 
 
 		 221 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 223 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  39.06 
 
 		 257 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  38.74 
 
 		 178 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  32.65 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  37.61 
 
 		 221 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5044  NLP/P60 family protein  40.4 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.982871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  34.09 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  34.09 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  34.09 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  34.06 
 
 		 171 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  38.68 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  36.7 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  34.09 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 208 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  38.28 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  36.7 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  41.12 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  36.7 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  40.4 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  36.7 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  36.7 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  36.7 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  36.7 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  36.7 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  34.04 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  36.54 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  43.88 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  34.04 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  36.97 
 
 		 535 aa  80.5  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  36.7 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  40 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  35.11 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  42.71 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  42.71 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  42.72 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  31.91 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>