More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1617 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 132 aa  270  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  55.81 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  56 
 
 		 131 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  58.4 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  42.42 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  41.6 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  37.88 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  42.06 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  35.25 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 138 aa  88.6  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 133 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  37.6 
 
 		 352 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  37.88 
 
 		 318 aa  85.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 		 200 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  38.4 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  40.8 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  40.8 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  36.8 
 
 		 352 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  37.69 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  38.81 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 153 aa  80.1  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  35.83 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.8 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  39.13 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  39.13 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  35.77 
 
 		 363 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  32.28 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  33.59 
 
 		 386 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  37.9 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  36.92 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  36.92 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  40.16 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  35.25 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  37.39 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  44.04 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  44.04 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  36.92 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  34.71 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  36.97 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  38.02 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  39.2 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  32.82 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  36.29 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  38.33 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  34.88 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  38.26 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  36.59 
 
 		 570 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  35.34 
 
 		 313 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.87 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.87 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.87 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  38.39 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  40.5 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  36.09 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>