More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1500 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  100 
 
 		 394 aa  810    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0260  peptidase  72.01 
 
 		 394 aa  591  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2961  peptidase  60.31 
 
 		 395 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1267  peptidase  59.03 
 
 		 394 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  57.51 
 
 		 394 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4537  peptidase  36.91 
 
 		 386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.468696  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  33.42 
 
 		 401 aa  210  4e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  32.99 
 
 		 401 aa  209  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  32.64 
 
 		 402 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  31.69 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1729  peptidase  30.46 
 
 		 400 aa  169  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02705  hypothetical protein  30.53 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0820  M20/DapE family protein YgeY  30.53 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02667  hypothetical protein  30.53 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3005  peptidase  30.53 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3032  peptidase  30.53 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0836  peptidase  30.53 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4162  peptidase  30.53 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3197  peptidase  30.28 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0240  peptidase  30.42 
 
 		 460 aa  154  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000787577  normal  0.24947 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  29.15 
 
 		 443 aa  152  8.999999999999999e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1432  peptidase  28.21 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1663  M20/DapE family protein YgeY  28 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  30.39 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  27.66 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1291  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.54 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.79 
 
 		 389 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  25.06 
 
 		 422 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.43 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.12 
 
 		 433 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  28.4 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  24.63 
 
 		 422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  24.82 
 
 		 422 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  24.82 
 
 		 422 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  24.82 
 
 		 422 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.01 
 
 		 395 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0287  peptidase M20  26.6 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  25.06 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  24.39 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  24.39 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  24.57 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.19 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  28.54 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.44 
 
 		 435 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.08 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3116  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.34 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.210379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  24.88 
 
 		 422 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.75 
 
 		 395 aa  109  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.9 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  24.51 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.23 
 
 		 431 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1541  peptidase M20  26.85 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  25.79 
 
 		 446 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.51 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.71 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1128  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.86 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3149  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.62 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2789  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.61 
 
 		 380 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.345284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  25.97 
 
 		 368 aa  106  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  24.52 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  26.67 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0549  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.06 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1150  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.2 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3265  acetylornithine deacetylase  26.17 
 
 		 416 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.366543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0628  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.25 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0578  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.85 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  25.45 
 
 		 364 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0642  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.76 
 
 		 402 aa  102  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.39661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02544  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.59 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0279642  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  27.89 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  26.65 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0406  acetylornithine deacetylase  25.97 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2475  acetylornithine deacetylase  25.63 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.94 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.3 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.25 
 
 		 375 aa  101  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  27.69 
 
 		 375 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  25.76 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.6 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2842  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.25 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7333  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.19 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  29.52 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0467  acetylornithine deacetylase  26.03 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0493  acetylornithine deacetylase  26.03 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.53 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  30.33 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1601  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.43 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0549352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1868  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24 
 
 		 375 aa  99.8  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26 
 
 		 375 aa  99.8  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0410  acetylornithine deacetylase  25.55 
 
 		 424 aa  99.4  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  26.69 
 
 		 390 aa  99.4  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2554  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.44 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1982  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.03 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  28.21 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.49 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0475  acetylornithine deacetylase  25.3 
 
 		 424 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0829  peptidase M20  29.85 
 
 		 372 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0413272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2418  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.2 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.508006  decreased coverage  0.00000131595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>