More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1519 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1519  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 657 aa  1332    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1262  TonB-dependent receptor  51.89 
 
 		 651 aa  664    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.612585  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1014  TonB-dependent receptor-related protein  49.39 
 
 		 647 aa  643    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1115  TonB-dependent receptor  55.54 
 
 		 649 aa  718    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.95294  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1064  TonB-dependent receptor  52.16 
 
 		 661 aa  654    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00188221  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1142  TonB-dependent receptor-related protein  51.89 
 
 		 650 aa  633  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.22175  normal  0.0805488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 679 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 701 aa  292  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 678 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 746 aa  212  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0028  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 641 aa  198  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1321  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 724 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 861 aa  172  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5364  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 729 aa  157  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  26.49 
 
 		 769 aa  156  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 634 aa  151  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 634 aa  151  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  27.49 
 
 		 639 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 619 aa  131  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 627 aa  127  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 614 aa  124  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  26.4 
 
 		 613 aa  121  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 626 aa  120  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.09 
 
 		 614 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.93 
 
 		 631 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.09 
 
 		 614 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 617 aa  118  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.09 
 
 		 614 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.34 
 
 		 614 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.09 
 
 		 614 aa  119  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.2 
 
 		 614 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.2 
 
 		 614 aa  117  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.2 
 
 		 614 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 638 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.19 
 
 		 623 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.2 
 
 		 614 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 626 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.27 
 
 		 614 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.2 
 
 		 614 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 688 aa  114  8.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.23 
 
 		 615 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 653 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.67 
 
 		 615 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 665 aa  111  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 698 aa  110  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 635 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  27.78 
 
 		 645 aa  110  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 642 aa  108  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1001  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 628 aa  107  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.11298  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  25.11 
 
 		 619 aa  106  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 698 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 602 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  26.68 
 
 		 628 aa  105  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 613 aa  105  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 616 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  23.57 
 
 		 746 aa  104  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.81 
 
 		 1023 aa  104  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  23.57 
 
 		 746 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  23.57 
 
 		 746 aa  103  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  23.57 
 
 		 746 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  23.57 
 
 		 746 aa  103  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 612 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 699 aa  102  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  23.43 
 
 		 746 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  23.43 
 
 		 746 aa  101  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  26.1 
 
 		 641 aa  101  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1301  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 634 aa  101  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.04 
 
 		 633 aa  100  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  24.3 
 
 		 695 aa  100  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  27.77 
 
 		 650 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  25.9 
 
 		 663 aa  99.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  26.07 
 
 		 621 aa  99.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  23.65 
 
 		 615 aa  99.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  24.75 
 
 		 618 aa  99.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 663 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  25.9 
 
 		 663 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  26.28 
 
 		 659 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  25.75 
 
 		 652 aa  98.6  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 658 aa  98.6  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  25.9 
 
 		 663 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  25.9 
 
 		 663 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.04 
 
 		 613 aa  98.2  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  34.78 
 
 		 646 aa  98.2  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  25.05 
 
 		 623 aa  98.6  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  25.9 
 
 		 663 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 635 aa  98.6  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 629 aa  98.2  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 652 aa  97.8  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 611 aa  97.8  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  27.16 
 
 		 650 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  25.91 
 
 		 698 aa  97.4  7e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 743 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  27.07 
 
 		 656 aa  97.4  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  27.16 
 
 		 650 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 690 aa  97.4  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  27.16 
 
 		 650 aa  97.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 614 aa  97.1  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0448  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  34.41 
 
 		 271 aa  96.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  24.42 
 
 		 653 aa  96.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0483  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  34.41 
 
 		 271 aa  96.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00522803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>