More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2442 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
382 aa  771    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  51.12 
 
 
358 aa  348  6e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  50.53 
 
 
381 aa  340  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  46.83 
 
 
374 aa  299  6e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  41.6 
 
 
379 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  42.26 
 
 
375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  44.06 
 
 
381 aa  279  5e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  37.3 
 
 
375 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 
396 aa  212  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
395 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
378 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
377 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
374 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
386 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
381 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
359 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  33.91 
 
 
357 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  27.88 
 
 
384 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  33.74 
 
 
364 aa  122  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
372 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  33.24 
 
 
358 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
397 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 
388 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  50.43 
 
 
405 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
666 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
396 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  36.26 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  27.5 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0955  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
428 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0106  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  34.38 
 
 
493 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
379 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
362 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
392 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
351 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
390 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
418 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 
373 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
417 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
419 aa  63.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
409 aa  62.8  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3994  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  25.65 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4039  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  25.65 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.25 
 
 
423 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  34.03 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
415 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
346 aa  61.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4100  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  25.13 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564193  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  34.35 
 
 
403 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0790  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
393 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
404 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3913  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  25.13 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0804  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
393 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  normal  0.0900137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  37.32 
 
 
443 aa  60.5  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
426 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0785  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
393 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.967061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
390 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.52 
 
 
353 aa  60.1  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
390 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 
422 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
394 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
379 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2179  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
388 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.416488  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  21.81 
 
 
419 aa  59.7  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
381 aa  59.7  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 
405 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.71 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
411 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  26.1 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  22.29 
 
 
381 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1435  glycogen/starch synthases, ADP-glucose type  27.45 
 
 
488 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26 
 
 
409 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.97 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3932  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  24.61 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
398 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>