More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0482 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  100 
 
 
442 aa  895    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03975  membrane-associated zinc metalloprotease  57.92 
 
 
440 aa  518  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419536  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  53.39 
 
 
444 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  46.28 
 
 
439 aa  389  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1159  peptidase M50  47.69 
 
 
447 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  43.4 
 
 
444 aa  336  5e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  42.33 
 
 
430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  40.36 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  42.98 
 
 
438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  41.53 
 
 
438 aa  280  5e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  36.75 
 
 
453 aa  243  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  36.4 
 
 
453 aa  239  5e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  35.86 
 
 
454 aa  237  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  34.92 
 
 
469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.22 
 
 
453 aa  234  3e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  36.4 
 
 
453 aa  228  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  34.73 
 
 
453 aa  228  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  33.48 
 
 
446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  32.3 
 
 
446 aa  182  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  28.1 
 
 
494 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.13 
 
 
455 aa  168  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  31.31 
 
 
438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.21 
 
 
441 aa  160  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  29.66 
 
 
428 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  25.82 
 
 
439 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  27.35 
 
 
454 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.45 
 
 
448 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.91 
 
 
480 aa  149  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  28.17 
 
 
466 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.89 
 
 
450 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.17 
 
 
450 aa  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  26.91 
 
 
454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  27.08 
 
 
469 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  28.85 
 
 
452 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.65 
 
 
457 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  26.96 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  26.28 
 
 
448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.99 
 
 
446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  27.43 
 
 
457 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  26.7 
 
 
450 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.62 
 
 
455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.22 
 
 
455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  27.85 
 
 
452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.57 
 
 
454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.48 
 
 
449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  29.09 
 
 
452 aa  130  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1638  membrane-associated zinc metalloprotease  28.26 
 
 
454 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  28.78 
 
 
456 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  27.62 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  26.3 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  26.04 
 
 
463 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  28 
 
 
461 aa  126  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1285  membrane-associated zinc metalloprotease  27.33 
 
 
462 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453164  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  27.67 
 
 
451 aa  126  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  27.53 
 
 
450 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28 
 
 
456 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.74 
 
 
450 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.51 
 
 
450 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  26.35 
 
 
451 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  28.54 
 
 
461 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.54 
 
 
451 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.64 
 
 
455 aa  124  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  27.79 
 
 
456 aa  123  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.16 
 
 
450 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.82 
 
 
458 aa  123  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  26.1 
 
 
450 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.67 
 
 
457 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.67 
 
 
457 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.71 
 
 
444 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  26.46 
 
 
457 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  27.58 
 
 
456 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  27.37 
 
 
450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  26.32 
 
 
456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2454  peptidase RseP  27.65 
 
 
443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000129388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.15 
 
 
456 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.39 
 
 
462 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.99 
 
 
450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  27.11 
 
 
452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.99 
 
 
452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  28.36 
 
 
461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1349  membrane-associated zinc metalloprotease  28.72 
 
 
462 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00245183  normal  0.774325 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1279  putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.02 
 
 
456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  24.95 
 
 
450 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  26.39 
 
 
462 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0534  protease EcfE  26.25 
 
 
459 aa  120  7e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.196657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.77 
 
 
454 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  26.4 
 
 
462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.1 
 
 
461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  26.56 
 
 
454 aa  119  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  26.55 
 
 
453 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1411  hypothetical protein  27.65 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.73492 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0574  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.31 
 
 
417 aa  117  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30609  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2710  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.06 
 
 
444 aa  117  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0608503  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.2 
 
 
453 aa  117  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.41 
 
 
456 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.73 
 
 
456 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  26.67 
 
 
456 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.46 
 
 
463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  28.39 
 
 
456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1367  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.28 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0141782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>