More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0470 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 238 aa  485  1e-136  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  48.77 
 
 		 276 aa  240  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  45.95 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  72.9 
 
 		 108 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  72.22 
 
 		 108 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  48.84 
 
 		 131 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.51 
 
 		 131 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  43.97 
 
 		 387 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.04 
 
 		 131 aa  131  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  54.95 
 
 		 140 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  54.95 
 
 		 140 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  48.84 
 
 		 134 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  54.95 
 
 		 140 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  46.15 
 
 		 131 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  44.62 
 
 		 132 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  48.06 
 
 		 171 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.33 
 
 		 131 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.96 
 
 		 131 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.15 
 
 		 132 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.69 
 
 		 140 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  46.15 
 
 		 132 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.62 
 
 		 137 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.92 
 
 		 135 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.31 
 
 		 131 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.85 
 
 		 133 aa  124  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  46.09 
 
 		 132 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.64 
 
 		 158 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.96 
 
 		 131 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.62 
 
 		 133 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  43.51 
 
 		 131 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 142 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  46.09 
 
 		 132 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.88 
 
 		 164 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1459  carboxymuconolactone decarboxylase  60.64 
 
 		 105 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.917437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.27 
 
 		 131 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  50.89 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  44.19 
 
 		 298 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.96 
 
 		 157 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  44.96 
 
 		 133 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  63.64 
 
 		 138 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  44.96 
 
 		 135 aa  121  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  52.94 
 
 		 107 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  43.41 
 
 		 131 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  46.15 
 
 		 133 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  44.35 
 
 		 156 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  60.87 
 
 		 139 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.96 
 
 		 163 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  41.86 
 
 		 141 aa  118  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.62 
 
 		 131 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  46.96 
 
 		 396 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  44.78 
 
 		 136 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  44.27 
 
 		 136 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  49.12 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0161  Carboxymuconolactone decarboxylase  62.07 
 
 		 105 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.19 
 
 		 131 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.08 
 
 		 131 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  42.19 
 
 		 157 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.31 
 
 		 131 aa  115  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  42.64 
 
 		 134 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.69 
 
 		 158 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  56.38 
 
 		 106 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  42.64 
 
 		 131 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  59.41 
 
 		 107 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  45.9 
 
 		 164 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  41.41 
 
 		 167 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  57.95 
 
 		 398 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  41.98 
 
 		 131 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.31 
 
 		 134 aa  111  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  42.64 
 
 		 136 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  37.98 
 
 		 132 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  41.22 
 
 		 136 aa  109  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  53 
 
 		 107 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  39.69 
 
 		 158 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6793  carboxymuconolactone decarboxylase  51.06 
 
 		 265 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215429  normal  0.323948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  41.86 
 
 		 141 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  37.3 
 
 		 141 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5696  carboxymuconolactone decarboxylase  52.17 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6060  carboxymuconolactone decarboxylase  52.17 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  38.17 
 
 		 156 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  38.17 
 
 		 156 aa  106  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  38.46 
 
 		 135 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  39.23 
 
 		 135 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  38.64 
 
 		 135 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2865  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  49.45 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133043  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  37.4 
 
 		 156 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  39.53 
 
 		 162 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1975  4-carboxymuconolactone decarboxylase  53.57 
 
 		 107 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05823e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1757  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.69 
 
 		 107 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2039  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.69 
 
 		 107 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.35 
 
 		 107 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  50.54 
 
 		 106 aa  102  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1761  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0864645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  48.31 
 
 		 265 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.69 
 
 		 135 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.24 
 
 		 165 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  40.94 
 
 		 403 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.76 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  41.09 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>