More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0329 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0329  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 308 aa  618  1e-176  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.810022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  29.04 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  26.73 
 
 		 308 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  25.61 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  25.66 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  26.5 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  25.51 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  27.74 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.6 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  26.44 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  27.24 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.74 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  26.77 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  26.28 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  26.28 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  26.28 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  26.28 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  26.28 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  25.84 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  25.34 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  26.94 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  29.23 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  27.93 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  27.27 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  23.81 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  25.26 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  27.99 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  23.46 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  25.67 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  26.72 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  23.3 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  25.96 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  27.36 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  24.22 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  28.52 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  25.99 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.72 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  24.57 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  25.82 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1140  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  23.77 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  26.39 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  27.36 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  26.06 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.53 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  27.56 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  27.04 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  25.32 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  23.61 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  27.04 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  27.85 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  25.32 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  25.32 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  25.09 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  23.71 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  23.71 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  22.61 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_25086  predicted protein  28.35 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300966  normal  0.110064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  27.55 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  24.83 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  24.75 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.26 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  28.69 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  24.84 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  23.13 
 
 		 403 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  24.64 
 
 		 645 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2287  PfkB domain protein  26.57 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  23.79 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  25.09 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  26.48 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  25 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  23.32 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  27.67 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  25.09 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2205  PfkB  26.81 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  28.09 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  28.09 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  26.74 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  24.64 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  28.09 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  24.46 
 
 		 337 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  25.95 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  26.48 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  24.56 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0595039 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  26.48 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  25.9 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  27.69 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  23.01 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  25.7 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  25.24 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  26.45 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  24.21 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  27.47 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  26.72 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  26.64 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.78 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  26.74 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  26.6 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>