More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1500 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  100 
 
 		 630 aa  1289    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  70.41 
 
 		 632 aa  888    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  76.51 
 
 		 629 aa  978    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  69.17 
 
 		 629 aa  909    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  70.75 
 
 		 630 aa  887    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  73.25 
 
 		 631 aa  927    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  74.92 
 
 		 632 aa  972    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  47.57 
 
 		 642 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  47.57 
 
 		 642 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  47.27 
 
 		 642 aa  599  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  46.51 
 
 		 639 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  47.62 
 
 		 631 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  47.78 
 
 		 631 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  47.78 
 
 		 631 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  47.78 
 
 		 631 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  47.78 
 
 		 631 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  47.46 
 
 		 631 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  47.78 
 
 		 631 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  47.94 
 
 		 631 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  47.46 
 
 		 630 aa  580  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 		 631 aa  580  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3020  ABC transporter-like  46.02 
 
 		 646 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.511953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  46.52 
 
 		 653 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 631 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  47.55 
 
 		 631 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3547  ABC transporter-like protein protein  46.01 
 
 		 640 aa  568  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0123  ABC transporter related  46.3 
 
 		 643 aa  552  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  46.71 
 
 		 641 aa  541  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  44.37 
 
 		 626 aa  540  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1093  ABC transporter related  42.46 
 
 		 634 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  42.68 
 
 		 636 aa  525  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 		 642 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  44.81 
 
 		 642 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18141  hypothetical protein  42.15 
 
 		 641 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0376333  normal  0.70207 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  41.86 
 
 		 652 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0950  ATPase  42.7 
 
 		 641 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.61977  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  41.87 
 
 		 644 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  43.59 
 
 		 630 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1225  ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 		 623 aa  496  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.701491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  41.61 
 
 		 622 aa  493  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  42.39 
 
 		 630 aa  492  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1822  ATPase  42.39 
 
 		 631 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0514  ATPase  42.66 
 
 		 633 aa  487  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11743  normal  0.506629 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  41.73 
 
 		 621 aa  488  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  39.84 
 
 		 613 aa  481  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 		 622 aa  476  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  40.51 
 
 		 620 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 		 627 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  39.87 
 
 		 625 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  39.87 
 
 		 625 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1340  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 622 aa  457  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  41.53 
 
 		 625 aa  458  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0462  ABC transporter ATPase  41.73 
 
 		 626 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3285  ABC transporter related  40 
 
 		 636 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000124669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1648  ABC transporter ATPase  40.88 
 
 		 623 aa  436  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0008  ABC transporter related  37.82 
 
 		 620 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.925372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3318  ABC transporter related protein  38.41 
 
 		 632 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0928  ABC transporter related  38.41 
 
 		 633 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11608e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2479  ABC transporter-related protein  40.07 
 
 		 634 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08326  putative ATP-binding component of ABC transporter  41.36 
 
 		 564 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0834  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.49 
 
 		 561 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00294599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2061  ABC transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 		 654 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3426  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.49 
 
 		 561 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1845  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 		 556 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  38.96 
 
 		 642 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  37.28 
 
 		 640 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1895  ABC transporter related  37.14 
 
 		 656 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2441  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.46 
 
 		 558 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00204105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  37.5 
 
 		 626 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0809  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.64 
 
 		 560 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1998  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.98 
 
 		 563 aa  406  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.237018  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0238  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.37 
 
 		 559 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1816  ABC transporter-related protein  37 
 
 		 654 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0210138  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1644  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 		 559 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4019  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.21 
 
 		 561 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.186099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.76 
 
 		 555 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1926  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.28 
 
 		 559 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000896956  normal  0.905041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2255  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.75 
 
 		 555 aa  401  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 555 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3463  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.37 
 
 		 550 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427951  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.69 
 
 		 555 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1361  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.12 
 
 		 561 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127735  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2810  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.69 
 
 		 555 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1281  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 		 561 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000308368  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1057  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 559 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0893  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.74 
 
 		 560 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.100195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 		 559 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  38.81 
 
 		 648 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  37.31 
 
 		 641 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3241  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.11 
 
 		 561 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000308971  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2913  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.91 
 
 		 555 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.010089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  37.62 
 
 		 663 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.84 
 
 		 551 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 		 559 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  37.17 
 
 		 688 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  38.27 
 
 		 641 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3380  ABC transporter related  35.87 
 
 		 651 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1117  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 		 558 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.406197  hitchhiker  0.00000247304 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1058  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.59 
 
 		 560 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0490  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 551 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.191061  normal  0.167217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>