72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0920 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  100 
 
 		 283 aa  535  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  35.44 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  39.86 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  40.74 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  33.57 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  36.93 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  35.32 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  37.96 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  37.33 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  34.58 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  32.96 
 
 		 379 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  37.55 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  30.94 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  32.58 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  34.07 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  36.1 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  32.45 
 
 		 253 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  35.04 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  40.59 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  36.65 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  33.69 
 
 		 271 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  30.85 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  30.57 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  33.33 
 
 		 278 aa  87.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  34.92 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  29.62 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  38.72 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  25.75 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  32.84 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  33.67 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  32.6 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  29.85 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  39.43 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  30.54 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  33.82 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  33.33 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  39.9 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  30.45 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  34.95 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  26.06 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  29.3 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  34.59 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5324  hypothetical protein  31.08 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  33.49 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  33.49 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  33.49 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  28.84 
 
 		 750 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3490  hypothetical protein  28.31 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  30.88 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  31.73 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  29.36 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03520  hypothetical protein  33.58 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.972538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2131  ABC transporter integral membrane protein  30.67 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  32.99 
 
 		 518 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  37.96 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2844  integral membrane protein  30.74 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0459878 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3741  ABC transporter permease  29.06 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  30.5 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  30.47 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1978  integral membrane protein  38.02 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  29.43 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  30 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0893  hypothetical protein  28.28 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  46.55 
 
 		 543 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  31.16 
 
 		 504 aa  45.8  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1805  hypothetical protein  28.36 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  29.32 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  35.19 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5874  hypothetical protein  32.17 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.138956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.365446  normal  0.429574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>