More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0700 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0700  urea ABC transporter, urea binding protein  100 
 
 
463 aa  942    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172324  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2596  extracellular ligand-binding receptor  73.02 
 
 
402 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  72.46 
 
 
421 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  73.51 
 
 
402 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  72.46 
 
 
421 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  71.5 
 
 
421 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1687  extracellular ligand-binding receptor  65.52 
 
 
413 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3240  urea ABC transporter, urea binding protein  64.43 
 
 
405 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00360419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3498  urea ABC transporter, urea binding protein  61.56 
 
 
419 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1674  urea ABC transporter, urea binding protein  63.28 
 
 
407 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  55.42 
 
 
418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  54.94 
 
 
419 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2862  urea ABC transporter, urea binding protein  57.38 
 
 
443 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4361  extracellular ligand-binding receptor  54.17 
 
 
438 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000367621  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2260  urea ABC transporter, urea binding protein  54.72 
 
 
440 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411735  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0130  extracellular ligand-binding receptor  53.19 
 
 
423 aa  415  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4910  extracellular ligand-binding receptor  49.87 
 
 
397 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29741  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  48.71 
 
 
431 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2418  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.86 
 
 
393 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1255  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic protein  49.73 
 
 
445 aa  365  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2205  extracellular ligand-binding receptor  49.86 
 
 
393 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0701  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  49.62 
 
 
421 aa  362  8e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525993  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3867  extracellular ligand-binding receptor  48.19 
 
 
421 aa  362  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3881  putative aliphatic amidase expression-regulating protein  48.79 
 
 
411 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1340  urea ABC transporter urea binding protein  50.13 
 
 
422 aa  359  5e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.231626 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2873  urea ABC transporter, urea binding protein  50.13 
 
 
422 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.862041  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3211  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
420 aa  359  6e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.35137  normal  0.840301 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2794  urea ABC transporter, urea binding protein  50.13 
 
 
422 aa  359  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2007  urea ABC transporter, urea binding protein  47.91 
 
 
405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2250  putative urea ABC transporter, urea binding protein  48.54 
 
 
431 aa  356  5e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.582147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3381  twin-arginine translocation pathway signal  49.61 
 
 
419 aa  355  1e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4841  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  48.1 
 
 
421 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.365474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4719  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  48.32 
 
 
421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  0.0383938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4426  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.97 
 
 
421 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0697  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.6 
 
 
425 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951166  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4012  urea ABC transporter, urea binding protein  48.7 
 
 
422 aa  352  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.394915  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4898  urea ABC transporter, urea binding protein  48.1 
 
 
421 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0308389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0590  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.74 
 
 
421 aa  352  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2161  urea ABC transporter, urea binding protein  45.37 
 
 
422 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1393  twin-arginine translocation pathway signal  48.04 
 
 
428 aa  352  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656328  normal  0.386042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64270  hypothetical protein  48.84 
 
 
421 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00916173  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2746  urea ABC transporter, urea binding protein  47.66 
 
 
423 aa  350  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276837  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2620  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  49.62 
 
 
432 aa  350  4e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0558299  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4633  urea ABC transporter, urea binding protein  47.59 
 
 
421 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688874  normal  0.0837107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0997  twin-arginine translocation pathway signal  47.64 
 
 
427 aa  349  6e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2500  urea ABC transporter, urea binding protein  45 
 
 
422 aa  349  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172849  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3931  urea ABC transporter, urea binding protein  47.56 
 
 
417 aa  349  7e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.606906  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1988  putative substrate-binding periplasmic transport protein  48.23 
 
 
423 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1421  putative substrate-binding periplasmic transport protein  45.48 
 
 
422 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1084  urea ABC transporter, urea binding protein  49.07 
 
 
425 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5579  hypothetical protein  48.32 
 
 
421 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0952  twin-arginine translocation pathway signal  46.56 
 
 
419 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553309  normal  0.40345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4885  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.32 
 
 
421 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3500  twin-arginine translocation pathway signal  47.14 
 
 
420 aa  346  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1443  twin-arginine translocation pathway signal  46.15 
 
 
420 aa  344  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0986  twin-arginine translocation pathway signal  47.86 
 
 
418 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3780  putative aliphatic amidase expression-regulating protein  46.99 
 
 
404 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.583472  hitchhiker  0.00053565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2193  urea ABC transporter, urea binding protein  44.66 
 
 
418 aa  342  8e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.200796 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1870  urea ABC transporter, urea binding protein  44.66 
 
 
418 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.510403  normal  0.303887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  44.17 
 
 
840 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2041  putative urea/short-chain amide-binding signal peptide protein  47.31 
 
 
418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0954  urea ABC transporter, urea binding protein  47.58 
 
 
431 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08881  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  47.89 
 
 
425 aa  337  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3683  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.58 
 
 
432 aa  336  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0564  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.15 
 
 
420 aa  336  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4184  ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  49.04 
 
 
430 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.11561 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0188  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  44.42 
 
 
444 aa  334  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2251  urea ABC transporter, urea binding protein  46.83 
 
 
433 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3112  urea ABC transporter, urea binding protein  45.2 
 
 
416 aa  333  4e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4229  hypothetical protein  46.55 
 
 
426 aa  333  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.527328  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1504  urea/short-chain amide ABC transporter, periplasmic urea/short-chain amide-binding protein  47.72 
 
 
435 aa  333  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00196796  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00881  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  48.04 
 
 
403 aa  333  5e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0787  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.31 
 
 
435 aa  332  8e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.238628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4078  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.93 
 
 
414 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.749846  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0798  urea ABC transporter, urea binding protein  47.18 
 
 
435 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.398503  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4014  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.51 
 
 
435 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0416471  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0948  branched-chain amino acid ABC transporter, putative  46.38 
 
 
427 aa  332  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1711  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.55 
 
 
421 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299695  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1139  urea ABC transporter, urea binding protein  45.55 
 
 
413 aa  331  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1048  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  47.5 
 
 
425 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.293483  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19191  putative urea ABC transporter, substrate binding protein  47.5 
 
 
425 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0880  urea ABC transporter, urea binding protein  46.51 
 
 
435 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.824913 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0431  twin-arginine translocation pathway signal  46.51 
 
 
435 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0910  ABC-type branched-chain amino acid transport system periplasmic component  46.51 
 
 
435 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988343  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2482  urea ABC transporter, urea binding protein  46.65 
 
 
435 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3864  amide-urea binding protein  45.6 
 
 
420 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3702  branched-chain amino acid uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  47.72 
 
 
439 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3572  ABC transporter substrate-binding protein  46.25 
 
 
422 aa  329  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536665  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3067  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.29 
 
 
435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656729  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3127  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.29 
 
 
435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1252  amide-urea binding protein  45.6 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0854371  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3103  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.29 
 
 
435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2176  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein, putative  46.04 
 
 
435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253407  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5668  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.55 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851164  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2048  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.04 
 
 
435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0410415  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1360  urea ABC transporter, urea binding protein  45.69 
 
 
413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1200  urea ABC transporter, urea binding protein  45.69 
 
 
413 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0654  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  43.73 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.379667 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2565  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.04 
 
 
435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000125255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0732  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.04 
 
 
435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.909457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>