174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06050 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_06050  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 
456 aa  932    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.807535  hitchhiker  0.00000000184751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1251  TPR repeat-containing protein  63.87 
 
 
452 aa  583  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09190  tetratricopeptide repeat protein  57.11 
 
 
455 aa  492  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.216592 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0669  Tetratricopeptide domain protein  35.42 
 
 
467 aa  239  5e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.774864  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  34.32 
 
 
576 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
1486 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
279 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 
534 aa  60.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
878 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.37 
 
 
626 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.52 
 
 
810 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  30.64 
 
 
626 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
614 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
614 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
620 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
750 aa  57  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.18 
 
 
689 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  30.07 
 
 
864 aa  56.6  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  30.06 
 
 
626 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  35.64 
 
 
1013 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  27.22 
 
 
391 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  26.16 
 
 
2327 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.06 
 
 
833 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.81 
 
 
614 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.81 
 
 
614 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
614 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  27.75 
 
 
1212 aa  54.7  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
3301 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
1737 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 
632 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 
250 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 
3035 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 
594 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 
991 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.78 
 
 
1694 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
739 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.3 
 
 
828 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
909 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  29.24 
 
 
1154 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
4489 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.7 
 
 
2145 aa  53.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  27.62 
 
 
219 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
750 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  27.62 
 
 
219 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 
784 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
592 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.15 
 
 
620 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
711 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 
629 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
3560 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 
219 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.86 
 
 
249 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
1276 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.86 
 
 
249 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.19 
 
 
730 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
356 aa  50.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 
654 aa  50.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 
219 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.96 
 
 
565 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 
716 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.64 
 
 
2240 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
1061 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
732 aa  50.1  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  27.14 
 
 
219 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 
219 aa  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  27.14 
 
 
219 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  27.14 
 
 
219 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.02 
 
 
357 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  29.31 
 
 
603 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  24.91 
 
 
462 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  26.89 
 
 
566 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
1094 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.5 
 
 
707 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.66 
 
 
476 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 
782 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
377 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
522 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.88 
 
 
222 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 
4079 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
522 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.33 
 
 
818 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  28.49 
 
 
398 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
219 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
639 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  27.04 
 
 
979 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
465 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  26.67 
 
 
219 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  26.67 
 
 
219 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  24.66 
 
 
1550 aa  48.5  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
468 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  27.35 
 
 
985 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
636 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
927 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
732 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 
245 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1121  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 
209 aa  48.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.685815  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.17 
 
 
1022 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
402 aa  47.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>