More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3410 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3410  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 639 aa  1313    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  42.52 
 
 		 618 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.5 
 
 		 615 aa  435  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.62 
 
 		 644 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2605  Beta-glucosidase  36.4 
 
 		 866 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4365  glycoside hydrolase family 3 protein  37.18 
 
 		 608 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2726  exo-1,4-beta-glucosidase  35.19 
 
 		 856 aa  392  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789433  normal  0.608447 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0245  exo-1,4-beta-glucosidase  36.76 
 
 		 862 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  38.01 
 
 		 612 aa  382  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1303  glycoside hydrolase family 3 protein  36.5 
 
 		 826 aa  381  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75334  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  37.05 
 
 		 1271 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03794  glucan 1,4-beta-glucosidase  37.65 
 
 		 850 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1439  glycoside hydrolase family 3 protein  37.54 
 
 		 850 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2497  exo-1,4-beta-glucosidase  35 
 
 		 1072 aa  375  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1318  Beta-glucosidase  34.87 
 
 		 880 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3740  putative endoglucanase A  35.06 
 
 		 599 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.821502  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  36.41 
 
 		 678 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0152  glycoside hydrolase family 3 protein  37.38 
 
 		 826 aa  369  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0748056 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  36.57 
 
 		 1271 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.94 
 
 		 619 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1185  glycoside hydrolase family 3 protein  35.1 
 
 		 886 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00253974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1133  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.29 
 
 		 886 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000321468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3172  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.1 
 
 		 886 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00636451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1218  glycoside hydrolase family 3 protein  35.1 
 
 		 886 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0296579  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1113  glycoside hydrolase family protein  33.63 
 
 		 866 aa  365  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0994195  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1511  Beta-glucosidase  34.29 
 
 		 826 aa  364  3e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1149  glycoside hydrolase family 3 protein  36.19 
 
 		 862 aa  364  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.418597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2072  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37 
 
 		 900 aa  359  8e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.177035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1611  Beta-glucosidase  32.52 
 
 		 811 aa  359  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00680  glucan 1,4-beta-glucosidase  34.04 
 
 		 844 aa  356  6.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6485  glycoside hydrolase family protein  35.84 
 
 		 900 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4963  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.78 
 
 		 877 aa  349  8e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.412113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3725  glycosy hydrolase family protein  34.31 
 
 		 605 aa  337  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1404  beta-glucosidase  36.05 
 
 		 859 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0412304  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  34.46 
 
 		 739 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.32 
 
 		 736 aa  308  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  31.49 
 
 		 755 aa  273  9e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  30.51 
 
 		 759 aa  256  8e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  28.55 
 
 		 758 aa  249  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  28.71 
 
 		 820 aa  248  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.05 
 
 		 762 aa  244  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2291  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.62 
 
 		 733 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  29.57 
 
 		 737 aa  243  7e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.02 
 
 		 702 aa  239  8e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2442  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.69 
 
 		 742 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  30.22 
 
 		 750 aa  234  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  29.66 
 
 		 766 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.25 
 
 		 828 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2737  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.65 
 
 		 743 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.728913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2514  glycoside hydrolase family 3 protein  29.12 
 
 		 743 aa  227  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.27 
 
 		 754 aa  226  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  27.58 
 
 		 740 aa  226  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.43 
 
 		 804 aa  224  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0397  Beta-glucosidase-related glycosidase  28.26 
 
 		 760 aa  223  6e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000776871 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  28.93 
 
 		 727 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  27.05 
 
 		 750 aa  223  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  28.64 
 
 		 745 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  28.93 
 
 		 727 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  28.35 
 
 		 765 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.19 
 
 		 751 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  28.32 
 
 		 738 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  28.35 
 
 		 753 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  28.62 
 
 		 774 aa  218  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  27.98 
 
 		 755 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  27.98 
 
 		 755 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  27.75 
 
 		 765 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  27.75 
 
 		 755 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  27.82 
 
 		 755 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4366  glycoside hydrolase family 3 protein  29.22 
 
 		 743 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  27.68 
 
 		 765 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  27.68 
 
 		 765 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  27.68 
 
 		 765 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  27.68 
 
 		 765 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  27.68 
 
 		 765 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  27.95 
 
 		 772 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  27.68 
 
 		 765 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  28.53 
 
 		 778 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.68 
 
 		 765 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  27.68 
 
 		 765 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  28.53 
 
 		 778 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  27.68 
 
 		 765 aa  213  9e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.34 
 
 		 723 aa  210  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.6 
 
 		 766 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  29.63 
 
 		 721 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  28.48 
 
 		 763 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.49 
 
 		 752 aa  206  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 		 772 aa  205  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.38 
 
 		 762 aa  204  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  27.88 
 
 		 763 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  27.88 
 
 		 763 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  28.31 
 
 		 763 aa  203  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  27.89 
 
 		 768 aa  203  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  27.62 
 
 		 763 aa  203  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  30.63 
 
 		 759 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  27.86 
 
 		 772 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 		 751 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.51 
 
 		 783 aa  201  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26742  beta-glucosidase  27.8 
 
 		 953 aa  200  7.999999999999999e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.62 
 
 		 733 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  29.5 
 
 		 765 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>