232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3344 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3344  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 343 aa  670    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395635  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1491  protein of unknown function UPF0118  47.6 
 
 		 340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.961051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1926  hypothetical protein  48.37 
 
 		 337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3416  hypothetical protein  47.77 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602255 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5231  hypothetical protein  47.02 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2006  hypothetical protein  47.48 
 
 		 337 aa  295  8e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.277817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1483  hypothetical protein  47.18 
 
 		 333 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5570  hypothetical protein  47.92 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5291  hypothetical protein  47.92 
 
 		 344 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5118  membrane protein  47.92 
 
 		 344 aa  292  7e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5133  membrane protein  47.92 
 
 		 344 aa  292  7e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000220099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5688  hypothetical protein  47.92 
 
 		 344 aa  292  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5533  hypothetical protein  47.92 
 
 		 344 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3955  hypothetical protein  46.22 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1783  hypothetical protein  47.48 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1762  hypothetical protein  47.48 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0301209  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1740  hypothetical protein  47.48 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1922  hypothetical protein  47.48 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2027  hypothetical protein  47.48 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0291717  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5387  hypothetical protein  49.19 
 
 		 314 aa  285  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.514486  normal  0.849251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5562  membrane protein YdbI  49.19 
 
 		 317 aa  285  8e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1958  hypothetical protein  47.48 
 
 		 337 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000222767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5618  hypothetical protein  49.19 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1797  hypothetical protein  47.81 
 
 		 339 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341958  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0039  permease  39.26 
 
 		 349 aa  235  7e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0130  hypothetical protein  36.65 
 
 		 341 aa  212  7e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1793  permease  31.25 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384748  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0313  permease  34.6 
 
 		 347 aa  146  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  30.05 
 
 		 412 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  29.56 
 
 		 412 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  28.44 
 
 		 412 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0642  protein of unknown function UPF0118  31.93 
 
 		 390 aa  94  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  25.23 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1482  hypothetical protein  34 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  23.64 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.6 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  22.05 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  22.44 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  25.34 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.33 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08190  predicted permease  21.99 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0210651 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1519  hypothetical protein  28.07 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  21.22 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  24.56 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  24.24 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  27.87 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  30.3 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  21.22 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  23.14 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  27.53 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1566  hypothetical protein  25.71 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.5 
 
 		 393 aa  57  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1632  hypothetical protein  25.71 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  25.27 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  25.27 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  27.82 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  23.4 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  23.4 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  23.4 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  23.4 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  23.4 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  24.07 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05050  predicted permease  22.9 
 
 		 405 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  23.05 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  26.14 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0546  hypothetical protein  26.9 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  23.05 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  23.53 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  20.15 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  23.72 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  21.29 
 
 		 400 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  23.05 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  24.81 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  24.86 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  27.85 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  19.61 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  22.92 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5901  hypothetical protein  29.35 
 
 		 364 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  20.86 
 
 		 412 aa  53.5  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  24.45 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2059  protein of unknown function UPF0118  23.11 
 
 		 406 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  29.41 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3669  hypothetical protein  22.99 
 
 		 390 aa  52.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  23.32 
 
 		 487 aa  53.1  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  28.09 
 
 		 375 aa  52.8  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  22.66 
 
 		 344 aa  52.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4059  protein of unknown function UPF0118  25.98 
 
 		 409 aa  52.8  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.793351  normal  0.664479 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  25 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  21.7 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  22.34 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0566  hypothetical protein  25 
 
 		 394 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.0679598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  23.33 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  23.08 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  26.56 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  32.32 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1233  protein of unknown function UPF0118  28.68 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3832  protein of unknown function UPF0118  20.92 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  24.63 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1164  hypothetical protein  24.3 
 
 		 457 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3833  protein of unknown function UPF0118  32.2 
 
 		 364 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>