202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0039 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0039  permease  100 
 
 		 349 aa  701    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0130  hypothetical protein  58.65 
 
 		 341 aa  389  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1491  protein of unknown function UPF0118  42.48 
 
 		 340 aa  292  7e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.961051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1926  hypothetical protein  41.32 
 
 		 337 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3416  hypothetical protein  41.32 
 
 		 337 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602255 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2006  hypothetical protein  42.09 
 
 		 337 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.277817  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5570  hypothetical protein  44.74 
 
 		 344 aa  255  8e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5291  hypothetical protein  44.74 
 
 		 344 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5118  membrane protein  44.74 
 
 		 344 aa  255  9e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5133  membrane protein  44.74 
 
 		 344 aa  255  9e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000220099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5688  hypothetical protein  44.74 
 
 		 344 aa  255  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5533  hypothetical protein  44.74 
 
 		 344 aa  255  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1783  hypothetical protein  42.09 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1762  hypothetical protein  42.09 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0301209  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1740  hypothetical protein  42.09 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1922  hypothetical protein  42.09 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1958  hypothetical protein  42.09 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000222767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2027  hypothetical protein  42.09 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0291717  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5562  membrane protein YdbI  45.48 
 
 		 317 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5231  hypothetical protein  43.24 
 
 		 344 aa  250  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5618  hypothetical protein  45.48 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5387  hypothetical protein  45.48 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.514486  normal  0.849251 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1483  hypothetical protein  40.73 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3955  hypothetical protein  42.52 
 
 		 347 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1797  hypothetical protein  41.95 
 
 		 339 aa  235  9e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341958  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3344  protein of unknown function UPF0118  39.26 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395635  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0313  permease  35.14 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1793  permease  30.75 
 
 		 331 aa  142  9e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0642  protein of unknown function UPF0118  34.64 
 
 		 390 aa  92.8  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  23.31 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  21.79 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1482  hypothetical protein  21.93 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  33.04 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  33.04 
 
 		 412 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  26.96 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  22.48 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  22.58 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  20.32 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  30.9 
 
 		 542 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  22.8 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  22.77 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  24.68 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  23.85 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  28.35 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2773  hypothetical protein  23.93 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  26 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.24 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.24 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.24 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.24 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.24 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  22.15 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  19.46 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  21.24 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  22.89 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  24.83 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  23.53 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  24.91 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  20.9 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.55 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  21.94 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  21.57 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  21.57 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  26.05 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  21.57 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  25.29 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  21.24 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  25.29 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  20.97 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.24 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  26.05 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  25.29 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  25.29 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  26.05 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  21.24 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  26.05 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  21.57 
 
 		 348 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  25.29 
 
 		 365 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  20.92 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1464  hypothetical protein  29.52 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  19.63 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  20.92 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  23.13 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  20.65 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  21.9 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  21.09 
 
 		 425 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  20.54 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  20.95 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  21.51 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1950  hypothetical protein  22.13 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  21.79 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1519  hypothetical protein  24.1 
 
 		 331 aa  54.7  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  21.45 
 
 		 365 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0546  hypothetical protein  20.66 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  21.03 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1463  protein of unknown function UPF0118  20.4 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  21.83 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  21.83 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  19.94 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  26.22 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>