77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5901 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5901  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  711    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5450  hypothetical protein  75.53 
 
 		 344 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.233374  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3642  hypothetical protein  47.93 
 
 		 341 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4719  putative transmembrane protein  47.93 
 
 		 341 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4846  putative permease  49.32 
 
 		 351 aa  277  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0316079  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00868  hypothetical protein  48.05 
 
 		 341 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153118  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6110  putative transporter  49.84 
 
 		 361 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.832573  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0608  hypothetical protein  49.54 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  normal  0.0309624 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2780  putative transporter  49.22 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550591  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2791  putative transporter  49.22 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4109  hypothetical protein  49.85 
 
 		 361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2166  putative transporter  49.22 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0497  hypothetical protein  49.83 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.591054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3791  putative permease  47.37 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2840  putative transporter  47.84 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2698  putative transporter  47.84 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.179654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0051  hypothetical protein  49.5 
 
 		 355 aa  259  6e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  0.686067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3366  hypothetical protein  43.12 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.79446  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0535  putative transporter  44.04 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4899  hypothetical protein  45.35 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0575  hypothetical protein  46.36 
 
 		 337 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3257  hypothetical protein  43.43 
 
 		 336 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1055  hypothetical protein  46.41 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.199381  normal  0.725462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4850  hypothetical protein  45.97 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0709425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4442  hypothetical protein  44.97 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4728  hypothetical protein  45.64 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4907  hypothetical protein  45.3 
 
 		 335 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122849 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0338  hypothetical protein  44.14 
 
 		 361 aa  249  8e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4642  hypothetical protein  44.63 
 
 		 335 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0065  hypothetical protein  48.46 
 
 		 361 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1525  hypothetical protein  48.46 
 
 		 361 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.916401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2953  hypothetical protein  48.46 
 
 		 361 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0608  hypothetical protein  48.46 
 
 		 361 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3096  hypothetical protein  48.46 
 
 		 344 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0778  hypothetical protein  48.12 
 
 		 344 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0592  hypothetical protein  48.12 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1242  hypothetical protein  44.14 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0925  hypothetical protein  40.37 
 
 		 336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0690  hypothetical protein  40.85 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4012  hypothetical protein  41.28 
 
 		 328 aa  228  9e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000045428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0815  hypothetical protein  40.24 
 
 		 329 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0964828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4104  hypothetical protein  40.98 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0130  hypothetical protein  37.5 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0643123  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2184  hypothetical protein  39.2 
 
 		 352 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1464  hypothetical protein  38.86 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1969  hypothetical protein  40.47 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0360  hypothetical protein  36.84 
 
 		 356 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2422  hypothetical protein  40.23 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1773  hypothetical protein  38.76 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2995  hypothetical protein  39.94 
 
 		 359 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.530889 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1740  hypothetical protein  36.84 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2006  hypothetical protein  36.84 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.277817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1958  hypothetical protein  36.84 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000222767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2027  hypothetical protein  36.84 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0291717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1922  hypothetical protein  36.84 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1762  hypothetical protein  36.84 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0301209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1783  hypothetical protein  36.84 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431279  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  24.92 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3416  hypothetical protein  36.09 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1926  hypothetical protein  36.09 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  32.59 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  31.82 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  31.06 
 
 		 412 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1483  hypothetical protein  33.83 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1797  hypothetical protein  33.83 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341958  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  30.48 
 
 		 429 aa  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  22.14 
 
 		 426 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  21.58 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3344  protein of unknown function UPF0118  28.16 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395635  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.03 
 
 		 396 aa  46.6  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  32.11 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  31.9 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  22.22 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0642  protein of unknown function UPF0118  31.69 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1491  protein of unknown function UPF0118  21.67 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.961051  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1793  permease  32.8 
 
 		 331 aa  44.3  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>