57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0575 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0575  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  656    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4899  hypothetical protein  80.71 
 
 		 336 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4642  hypothetical protein  83.58 
 
 		 335 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4907  hypothetical protein  83.58 
 
 		 335 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4728  hypothetical protein  82.69 
 
 		 335 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4850  hypothetical protein  82.09 
 
 		 355 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0709425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4442  hypothetical protein  83.09 
 
 		 336 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3257  hypothetical protein  50.93 
 
 		 336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3366  hypothetical protein  50.63 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.79446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0690  hypothetical protein  53.09 
 
 		 336 aa  298  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0925  hypothetical protein  52.16 
 
 		 336 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1055  hypothetical protein  52.41 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.199381  normal  0.725462 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0497  hypothetical protein  49.66 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.591054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6110  putative transporter  48.98 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.832573  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0535  putative transporter  47.32 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4109  hypothetical protein  48.15 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2166  putative transporter  48.64 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2780  putative transporter  48.64 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550591  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2791  putative transporter  48.64 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0608  hypothetical protein  48.46 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  normal  0.0309624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2698  putative transporter  48.29 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.179654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2840  putative transporter  48.29 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3096  hypothetical protein  50.51 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0065  hypothetical protein  50.51 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1525  hypothetical protein  50.51 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.916401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0608  hypothetical protein  50.51 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2953  hypothetical protein  50.51 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0338  hypothetical protein  49.66 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0592  hypothetical protein  50.17 
 
 		 361 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0778  hypothetical protein  50.17 
 
 		 344 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204858  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4846  putative permease  45.48 
 
 		 351 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0316079  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5450  hypothetical protein  44.73 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.233374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5901  hypothetical protein  46.77 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3791  putative permease  45.07 
 
 		 351 aa  252  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0130  hypothetical protein  44.41 
 
 		 335 aa  245  9.999999999999999e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0643123  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3642  hypothetical protein  41.95 
 
 		 341 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4719  putative transmembrane protein  41.95 
 
 		 341 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0051  hypothetical protein  45.36 
 
 		 355 aa  239  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  0.686067 
 
 
-
 
NC_003296  RS00868  hypothetical protein  40.43 
 
 		 341 aa  225  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153118  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4012  hypothetical protein  43.73 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000045428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4104  hypothetical protein  42.77 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0815  hypothetical protein  38.98 
 
 		 329 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0964828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1242  hypothetical protein  45.81 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1464  hypothetical protein  37.82 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2184  hypothetical protein  37.92 
 
 		 352 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0360  hypothetical protein  43.35 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1969  hypothetical protein  38.72 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1773  hypothetical protein  41.05 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2422  hypothetical protein  42.5 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2995  hypothetical protein  42.5 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.530889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  28.87 
 
 		 392 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  30.53 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  31.15 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  31.15 
 
 		 412 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  29.23 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  30.33 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  23.64 
 
 		 542 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>