73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4846 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4846  putative permease  100 
 
 		 351 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0316079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3791  putative permease  78.06 
 
 		 351 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5450  hypothetical protein  50.78 
 
 		 344 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.233374  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0051  hypothetical protein  51.86 
 
 		 355 aa  292  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  0.686067 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2791  putative transporter  50.17 
 
 		 360 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2166  putative transporter  50.17 
 
 		 360 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6110  putative transporter  48.37 
 
 		 361 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.832573  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2780  putative transporter  50.17 
 
 		 360 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550591  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2698  putative transporter  47.48 
 
 		 360 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.179654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2840  putative transporter  47.48 
 
 		 360 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0535  putative transporter  47.52 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5901  hypothetical protein  49.31 
 
 		 364 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596519 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0497  hypothetical protein  47.16 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.591054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4899  hypothetical protein  45.45 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0575  hypothetical protein  45.48 
 
 		 337 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4442  hypothetical protein  44.7 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4719  putative transmembrane protein  45.79 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3642  hypothetical protein  45.79 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4907  hypothetical protein  44.82 
 
 		 335 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1055  hypothetical protein  48.08 
 
 		 341 aa  255  8e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.199381  normal  0.725462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4850  hypothetical protein  44.82 
 
 		 355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0709425 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0592  hypothetical protein  47.16 
 
 		 361 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855578  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00868  hypothetical protein  45.37 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153118  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4728  hypothetical protein  44.15 
 
 		 335 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0608  hypothetical protein  44.99 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  normal  0.0309624 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3096  hypothetical protein  46.87 
 
 		 344 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4109  hypothetical protein  45.43 
 
 		 361 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2953  hypothetical protein  46.87 
 
 		 361 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0608  hypothetical protein  46.87 
 
 		 361 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1525  hypothetical protein  46.87 
 
 		 361 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.916401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0065  hypothetical protein  46.87 
 
 		 361 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4642  hypothetical protein  43.14 
 
 		 335 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0778  hypothetical protein  46.57 
 
 		 344 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204858  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3257  hypothetical protein  41.67 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3366  hypothetical protein  41.18 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.79446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4012  hypothetical protein  44.21 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000045428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0338  hypothetical protein  44 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4104  hypothetical protein  44.21 
 
 		 328 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0815  hypothetical protein  43.58 
 
 		 329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0964828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1242  hypothetical protein  45.23 
 
 		 330 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0690  hypothetical protein  41.5 
 
 		 336 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0925  hypothetical protein  40.85 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0130  hypothetical protein  38.1 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0643123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1464  hypothetical protein  37.54 
 
 		 354 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0360  hypothetical protein  35.75 
 
 		 356 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1969  hypothetical protein  39.64 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2184  hypothetical protein  43.57 
 
 		 352 aa  179  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1773  hypothetical protein  40.89 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2422  hypothetical protein  45.64 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2995  hypothetical protein  45.64 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.530889 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  21.92 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1491  protein of unknown function UPF0118  21.71 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.961051  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  32.84 
 
 		 412 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  32.84 
 
 		 412 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  32.84 
 
 		 412 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1958  hypothetical protein  32.03 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000222767 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1922  hypothetical protein  32.03 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1740  hypothetical protein  32.03 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1762  hypothetical protein  32.03 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0301209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1783  hypothetical protein  32.03 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2027  hypothetical protein  32.03 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0291717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  21.23 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3416  hypothetical protein  33.09 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1926  hypothetical protein  33.09 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2006  hypothetical protein  32.03 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.277817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  34.46 
 
 		 392 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  27.23 
 
 		 394 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1483  hypothetical protein  29.41 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  29.31 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1797  hypothetical protein  31.62 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341958  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0642  protein of unknown function UPF0118  32.33 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  31.45 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  31.15 
 
 		 418 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>