63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3257 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3257  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  660    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3366  hypothetical protein  92.26 
 
 		 336 aa  600  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.79446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0925  hypothetical protein  81.25 
 
 		 336 aa  528  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0690  hypothetical protein  80.65 
 
 		 336 aa  521  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4899  hypothetical protein  51.34 
 
 		 336 aa  318  7e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4442  hypothetical protein  52.68 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4850  hypothetical protein  50 
 
 		 355 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0709425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4728  hypothetical protein  50 
 
 		 335 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0575  hypothetical protein  50.77 
 
 		 337 aa  295  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4642  hypothetical protein  48.79 
 
 		 335 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4907  hypothetical protein  49.39 
 
 		 335 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122849 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0130  hypothetical protein  44.44 
 
 		 335 aa  264  1e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0643123  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5450  hypothetical protein  41.36 
 
 		 344 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.233374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5901  hypothetical protein  43.43 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1055  hypothetical protein  43.03 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.199381  normal  0.725462 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0497  hypothetical protein  43.81 
 
 		 344 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.591054  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3642  hypothetical protein  39.64 
 
 		 341 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4719  putative transmembrane protein  39.64 
 
 		 341 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_003296  RS00868  hypothetical protein  40.06 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153118  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6110  putative transporter  40.88 
 
 		 361 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.832573  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4846  putative permease  41.64 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0316079  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0608  hypothetical protein  41.21 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  normal  0.0309624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2698  putative transporter  41.19 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.179654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2840  putative transporter  41.19 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4109  hypothetical protein  40.3 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2166  putative transporter  41.85 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2791  putative transporter  41.85 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2780  putative transporter  41.85 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550591  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0535  putative transporter  40.13 
 
 		 363 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0338  hypothetical protein  42.81 
 
 		 361 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224115  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3096  hypothetical protein  43.14 
 
 		 344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0065  hypothetical protein  43.14 
 
 		 361 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2953  hypothetical protein  43.14 
 
 		 361 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1525  hypothetical protein  43.14 
 
 		 361 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.916401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0608  hypothetical protein  43.14 
 
 		 361 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0051  hypothetical protein  40.53 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  0.686067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3791  putative permease  42.12 
 
 		 351 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0778  hypothetical protein  42.81 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0592  hypothetical protein  42.81 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1242  hypothetical protein  41 
 
 		 330 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4012  hypothetical protein  35.67 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000045428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4104  hypothetical protein  35.99 
 
 		 328 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0815  hypothetical protein  34.63 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0964828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1464  hypothetical protein  35.03 
 
 		 354 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2184  hypothetical protein  34.52 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0360  hypothetical protein  39.83 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1773  hypothetical protein  37.5 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1969  hypothetical protein  31.29 
 
 		 352 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2995  hypothetical protein  38.1 
 
 		 359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.530889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2422  hypothetical protein  38.1 
 
 		 359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244559  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  33.57 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  32.86 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  32.86 
 
 		 412 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  31.43 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  36.17 
 
 		 392 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  22.15 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  29.29 
 
 		 394 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  29.71 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  29.71 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  29.71 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3416  hypothetical protein  30.66 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1926  hypothetical protein  30.66 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  26.34 
 
 		 400 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>