51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4907 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4728  hypothetical protein  98.51 
 
 		 335 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4907  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  648    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4850  hypothetical protein  97.61 
 
 		 355 aa  600  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0709425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4642  hypothetical protein  95.52 
 
 		 335 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0575  hypothetical protein  83.58 
 
 		 337 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4899  hypothetical protein  77.84 
 
 		 336 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4442  hypothetical protein  80.24 
 
 		 336 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0925  hypothetical protein  51.21 
 
 		 336 aa  305  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0690  hypothetical protein  51.21 
 
 		 336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3257  hypothetical protein  49.39 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3366  hypothetical protein  49.09 
 
 		 336 aa  299  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.79446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1055  hypothetical protein  51.38 
 
 		 341 aa  286  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.199381  normal  0.725462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6110  putative transporter  48.97 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.832573  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2166  putative transporter  49.32 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2780  putative transporter  49.32 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550591  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2791  putative transporter  49.32 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2840  putative transporter  48.97 
 
 		 360 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2698  putative transporter  48.97 
 
 		 360 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.179654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0535  putative transporter  48.12 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0608  hypothetical protein  46.65 
 
 		 361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  normal  0.0309624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4109  hypothetical protein  46.65 
 
 		 361 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0497  hypothetical protein  47.95 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.591054  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0338  hypothetical protein  50 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5450  hypothetical protein  45.23 
 
 		 344 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.233374  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4846  putative permease  44.82 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0316079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3096  hypothetical protein  49.15 
 
 		 344 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2953  hypothetical protein  49.15 
 
 		 361 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0608  hypothetical protein  49.15 
 
 		 361 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1525  hypothetical protein  49.15 
 
 		 361 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.916401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0065  hypothetical protein  49.15 
 
 		 361 aa  256  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0778  hypothetical protein  48.81 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0592  hypothetical protein  48.81 
 
 		 361 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855578  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0130  hypothetical protein  46.2 
 
 		 335 aa  251  8.000000000000001e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0643123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3791  putative permease  45.39 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0051  hypothetical protein  45.75 
 
 		 355 aa  246  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  0.686067 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5901  hypothetical protein  45.58 
 
 		 364 aa  245  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596519 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4719  putative transmembrane protein  40.99 
 
 		 341 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3642  hypothetical protein  40.99 
 
 		 341 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00868  hypothetical protein  40.6 
 
 		 341 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153118  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4012  hypothetical protein  42.81 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000045428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4104  hypothetical protein  41.53 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1464  hypothetical protein  39.53 
 
 		 354 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0815  hypothetical protein  37.69 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0964828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1242  hypothetical protein  44.4 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2184  hypothetical protein  39.05 
 
 		 352 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0360  hypothetical protein  44.78 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1969  hypothetical protein  38.78 
 
 		 352 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1773  hypothetical protein  40.85 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2995  hypothetical protein  37.24 
 
 		 359 aa  146  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.530889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2422  hypothetical protein  37.24 
 
 		 359 aa  146  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  27.75 
 
 		 429 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>