69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5450 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5450  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.233374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5901  hypothetical protein  74.27 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.596519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4846  putative permease  50.5 
 
 		 351 aa  278  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0316079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1055  hypothetical protein  48.82 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.199381  normal  0.725462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6110  putative transporter  48.44 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.832573  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0051  hypothetical protein  50.17 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  0.686067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3791  putative permease  48.84 
 
 		 351 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00868  hypothetical protein  45.27 
 
 		 341 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153118  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3642  hypothetical protein  46.18 
 
 		 341 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4719  putative transmembrane protein  46.18 
 
 		 341 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2780  putative transporter  47.81 
 
 		 360 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550591  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2166  putative transporter  47.81 
 
 		 360 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2791  putative transporter  47.81 
 
 		 360 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1242  hypothetical protein  45.23 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3257  hypothetical protein  42.81 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3366  hypothetical protein  42.81 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.79446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2698  putative transporter  46.6 
 
 		 360 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.179654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2840  putative transporter  46.6 
 
 		 360 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0497  hypothetical protein  48.12 
 
 		 344 aa  255  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.591054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4907  hypothetical protein  46.46 
 
 		 335 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0535  putative transporter  46.42 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4012  hypothetical protein  45.12 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000045428  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4728  hypothetical protein  46.13 
 
 		 335 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4899  hypothetical protein  44.31 
 
 		 336 aa  252  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4642  hypothetical protein  45.12 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4850  hypothetical protein  46.13 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0709425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0608  hypothetical protein  47.66 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  normal  0.0309624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4442  hypothetical protein  44.78 
 
 		 336 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0575  hypothetical protein  44.78 
 
 		 337 aa  249  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0925  hypothetical protein  44.63 
 
 		 336 aa  249  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4104  hypothetical protein  44.21 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4109  hypothetical protein  47.35 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0690  hypothetical protein  44.63 
 
 		 336 aa  245  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0815  hypothetical protein  43.69 
 
 		 329 aa  245  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0964828  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0338  hypothetical protein  45.78 
 
 		 361 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1525  hypothetical protein  48.28 
 
 		 361 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.916401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2953  hypothetical protein  48.28 
 
 		 361 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0065  hypothetical protein  48.28 
 
 		 361 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0608  hypothetical protein  48.28 
 
 		 361 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3096  hypothetical protein  48.28 
 
 		 344 aa  235  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0592  hypothetical protein  48.28 
 
 		 361 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855578  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0778  hypothetical protein  47.96 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204858  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0130  hypothetical protein  36.34 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0643123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1464  hypothetical protein  37.87 
 
 		 354 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0360  hypothetical protein  36.56 
 
 		 356 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2184  hypothetical protein  40.25 
 
 		 352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1969  hypothetical protein  37.69 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1773  hypothetical protein  37.11 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2995  hypothetical protein  41.91 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.530889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2422  hypothetical protein  41.91 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244559  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1783  hypothetical protein  33.58 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2006  hypothetical protein  33.58 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.277817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1740  hypothetical protein  33.58 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1762  hypothetical protein  33.58 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0301209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1958  hypothetical protein  33.58 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000222767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2027  hypothetical protein  33.58 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0291717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1922  hypothetical protein  33.58 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3416  hypothetical protein  32.84 
 
 		 337 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602255 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1926  hypothetical protein  32.84 
 
 		 337 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1491  protein of unknown function UPF0118  22.8 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.961051  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  27.35 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  22.84 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1483  hypothetical protein  29.5 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  32.37 
 
 		 412 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  30.08 
 
 		 429 aa  43.9  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1797  hypothetical protein  31.34 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  32.37 
 
 		 412 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3344  protein of unknown function UPF0118  23 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  30.37 
 
 		 412 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>