74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6110 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2791  putative transporter  94.46 
 
 
360 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.24148 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2698  putative transporter  93.35 
 
 
360 aa  643    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.179654 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2780  putative transporter  94.46 
 
 
360 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550591  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2840  putative transporter  93.35 
 
 
360 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2166  putative transporter  94.46 
 
 
360 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6110  putative transporter  100 
 
 
361 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.832573  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0535  putative transporter  90.3 
 
 
363 aa  630  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.354046  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0608  hypothetical protein  81.44 
 
 
361 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1525  hypothetical protein  81.44 
 
 
361 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.916401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0065  hypothetical protein  81.44 
 
 
361 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2953  hypothetical protein  81.44 
 
 
361 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.174951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0592  hypothetical protein  81.16 
 
 
361 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855578  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0497  hypothetical protein  81.69 
 
 
344 aa  533  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.591054  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0778  hypothetical protein  81.98 
 
 
344 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204858  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3096  hypothetical protein  82.27 
 
 
344 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4109  hypothetical protein  71.75 
 
 
361 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0608  hypothetical protein  72.02 
 
 
361 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  normal  0.0309624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0338  hypothetical protein  67.59 
 
 
361 aa  448  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224115  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1055  hypothetical protein  50.46 
 
 
341 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.199381  normal  0.725462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4846  putative permease  49.17 
 
 
351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0316079  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5450  hypothetical protein  48.44 
 
 
344 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.233374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4850  hypothetical protein  49.66 
 
 
355 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0709425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4728  hypothetical protein  49.32 
 
 
335 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4907  hypothetical protein  48.97 
 
 
335 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122849 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0575  hypothetical protein  48.98 
 
 
337 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4642  hypothetical protein  48.63 
 
 
335 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4899  hypothetical protein  46.39 
 
 
336 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4442  hypothetical protein  46.23 
 
 
336 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978049  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3791  putative permease  49.13 
 
 
351 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5901  hypothetical protein  49.84 
 
 
364 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.596519 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0051  hypothetical protein  49.16 
 
 
355 aa  260  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  0.686067 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4719  putative transmembrane protein  41.69 
 
 
341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3642  hypothetical protein  41.69 
 
 
341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3366  hypothetical protein  42.28 
 
 
336 aa  238  8e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.79446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0925  hypothetical protein  42.62 
 
 
336 aa  238  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3257  hypothetical protein  40.94 
 
 
336 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0690  hypothetical protein  41.61 
 
 
336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4012  hypothetical protein  40.8 
 
 
328 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000045428  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0815  hypothetical protein  41.07 
 
 
329 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0964828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4104  hypothetical protein  40.18 
 
 
328 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00868  hypothetical protein  42.33 
 
 
341 aa  226  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153118  normal  0.505723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1242  hypothetical protein  42.28 
 
 
330 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0130  hypothetical protein  39.08 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0643123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0360  hypothetical protein  34.96 
 
 
356 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.949726  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1464  hypothetical protein  38.93 
 
 
354 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2184  hypothetical protein  36.04 
 
 
352 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.398827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1969  hypothetical protein  36.8 
 
 
352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1773  hypothetical protein  37.94 
 
 
343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2422  hypothetical protein  40.91 
 
 
359 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2995  hypothetical protein  40.91 
 
 
359 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.530131  normal  0.530889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  23.84 
 
 
404 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  30.08 
 
 
412 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3416  hypothetical protein  29.71 
 
 
337 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602255 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  29.27 
 
 
412 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1926  hypothetical protein  29.71 
 
 
337 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1762  hypothetical protein  29.71 
 
 
337 aa  49.7  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0301209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1783  hypothetical protein  29.71 
 
 
337 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1922  hypothetical protein  29.71 
 
 
337 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1740  hypothetical protein  29.71 
 
 
337 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1958  hypothetical protein  29.71 
 
 
337 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000222767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2027  hypothetical protein  29.71 
 
 
337 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0291717  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  28.46 
 
 
412 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2006  hypothetical protein  29.71 
 
 
337 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.277817  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  27.76 
 
 
429 aa  47.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  30.22 
 
 
418 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  28.86 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0130  hypothetical protein  32.12 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1797  hypothetical protein  28.99 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341958  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  28.28 
 
 
476 aa  44.3  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08290  predicted permease  24.9 
 
 
367 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1483  hypothetical protein  27.54 
 
 
333 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  23.27 
 
 
390 aa  43.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  30.23 
 
 
526 aa  42.7  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3955  hypothetical protein  30 
 
 
347 aa  42.7  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>