More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2075 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  40.57 
 
 		 903 aa  638    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  40.57 
 
 		 891 aa  655    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  45.91 
 
 		 876 aa  752    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  45.97 
 
 		 877 aa  779    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  45.97 
 
 		 877 aa  780    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  45.97 
 
 		 891 aa  780    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  45.97 
 
 		 891 aa  780    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  45.97 
 
 		 891 aa  780    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  48.1 
 
 		 872 aa  796    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  45.03 
 
 		 876 aa  742    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  45.75 
 
 		 877 aa  776    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  43.22 
 
 		 873 aa  692    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  44.51 
 
 		 878 aa  741    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  45.67 
 
 		 877 aa  770    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  60.96 
 
 		 894 aa  1091    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  46.99 
 
 		 883 aa  795    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  46.3 
 
 		 877 aa  782    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  40.07 
 
 		 878 aa  638    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  39.28 
 
 		 892 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  39.42 
 
 		 891 aa  652    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  45.97 
 
 		 877 aa  780    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  42.17 
 
 		 879 aa  680    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  46.13 
 
 		 876 aa  764    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  42.62 
 
 		 885 aa  701    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  100 
 
 		 896 aa  1827    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  45.75 
 
 		 877 aa  776    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  43.85 
 
 		 888 aa  716    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  43.3 
 
 		 868 aa  674    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  44.67 
 
 		 870 aa  746    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  46.11 
 
 		 877 aa  786    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  48.32 
 
 		 866 aa  785    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  48.32 
 
 		 866 aa  785    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  40.31 
 
 		 903 aa  637    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  46.82 
 
 		 878 aa  776    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  46.13 
 
 		 876 aa  764    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  44.59 
 
 		 866 aa  734    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1892  DNA polymerase I  43.63 
 
 		 930 aa  691    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  46.57 
 
 		 850 aa  750    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  39.63 
 
 		 877 aa  640    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 903 aa  637    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  42.59 
 
 		 896 aa  701    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  41.46 
 
 		 893 aa  669    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  41.97 
 
 		 879 aa  644    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  39.84 
 
 		 902 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  46.67 
 
 		 888 aa  752    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  43.16 
 
 		 895 aa  732    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 892 aa  664    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  39.6 
 
 		 903 aa  632  1e-180  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  39.36 
 
 		 892 aa  633  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  39.7 
 
 		 892 aa  634  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  39.36 
 
 		 893 aa  634  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  40.57 
 
 		 892 aa  629  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  40.95 
 
 		 880 aa  625  1e-177  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  39.49 
 
 		 875 aa  623  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  39.4 
 
 		 888 aa  619  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  41.32 
 
 		 893 aa  616  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  41.47 
 
 		 893 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 939 aa  610  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  38.55 
 
 		 956 aa  608  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  37.27 
 
 		 906 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  38.15 
 
 		 926 aa  600  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  37.06 
 
 		 926 aa  597  1e-169  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  39.12 
 
 		 843 aa  596  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  38.51 
 
 		 926 aa  593  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  36.52 
 
 		 911 aa  593  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  38.19 
 
 		 930 aa  590  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  39.62 
 
 		 898 aa  589  1e-167  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  37.37 
 
 		 936 aa  587  1e-166  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  37.07 
 
 		 893 aa  582  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  36 
 
 		 934 aa  581  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  35.59 
 
 		 910 aa  581  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  35.96 
 
 		 904 aa  581  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  36.41 
 
 		 901 aa  580  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  37 
 
 		 884 aa  582  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  36.64 
 
 		 951 aa  581  1e-164  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  37.69 
 
 		 893 aa  578  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  37.96 
 
 		 924 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  37 
 
 		 916 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  36.47 
 
 		 911 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  37.13 
 
 		 949 aa  574  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  38.63 
 
 		 912 aa  575  1.0000000000000001e-162  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  36.49 
 
 		 928 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  36.92 
 
 		 903 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 901 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  40.18 
 
 		 890 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  35.86 
 
 		 909 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  36.53 
 
 		 920 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  36.53 
 
 		 920 aa  571  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  36.39 
 
 		 929 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  39.58 
 
 		 855 aa  566  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  35.63 
 
 		 908 aa  568  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  35.24 
 
 		 955 aa  568  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  37.01 
 
 		 936 aa  568  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  37.64 
 
 		 950 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 944 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  37.58 
 
 		 908 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  37.67 
 
 		 936 aa  562  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 928 aa  560  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 928 aa  560  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  37.03 
 
 		 928 aa  560  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>