More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1673 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
283 aa  577  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.54 
 
 
283 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0703  D-mannonate oxidoreductase  64.75 
 
 
279 aa  356  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1598  D-mannonate oxidoreductase  61.37 
 
 
281 aa  355  3.9999999999999996e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00242359  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.18 
 
 
274 aa  325  6e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2698  D-mannonate oxidoreductase  54.64 
 
 
281 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.1 
 
 
274 aa  255  7e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.96 
 
 
273 aa  252  4.0000000000000004e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34118  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.14 
 
 
276 aa  248  8e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.52 
 
 
274 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.768044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.48 
 
 
284 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.52 
 
 
277 aa  232  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234758  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4190  D-mannonate oxidoreductase  44.77 
 
 
270 aa  228  8e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203322  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3723  D-mannonate oxidoreductase  42.86 
 
 
277 aa  218  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3914  D-mannonate oxidoreductase  43.01 
 
 
277 aa  217  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374414  normal  0.041983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
270 aa  203  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0080  D-mannonate oxidoreductase  42.06 
 
 
281 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.66 
 
 
273 aa  195  8.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
262 aa  152  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0896711  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
257 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
276 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  34.55 
 
 
259 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
257 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 
260 aa  135  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  32.47 
 
 
254 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  36.94 
 
 
254 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1576  gluconate 5-dehydrogenase  33.57 
 
 
289 aa  135  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1601  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786043  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  34.78 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  33.57 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 
253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1470  gluconate 5-dehydrogenase  33.94 
 
 
254 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.22 
 
 
251 aa  132  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  33.81 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
260 aa  132  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.21 
 
 
255 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
256 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  33.81 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4263  gluconate 5-dehydrogenase  29.89 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  30.6 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
253 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  32.1 
 
 
255 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  32.5 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.96 
 
 
251 aa  125  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  33.94 
 
 
253 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  31.73 
 
 
264 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3615  putative dehydrogenase  30.86 
 
 
291 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.427411  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4672  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.87 
 
 
253 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  34.53 
 
 
261 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  32.01 
 
 
272 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  32.01 
 
 
272 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
257 aa  123  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
255 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
255 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
255 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  30.6 
 
 
260 aa  122  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
260 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.72 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.09 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  31.75 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.99 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.400321  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  32.36 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  33.21 
 
 
255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  32.13 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
253 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0222  gluconate 5-dehydrogenase  30.32 
 
 
254 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  30.94 
 
 
263 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  31.88 
 
 
254 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2383  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.09 
 
 
253 aa  120  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.2 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
256 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
256 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1716  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.15 
 
 
253 aa  118  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  30.66 
 
 
262 aa  118  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.48 
 
 
250 aa  118  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
255 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.11 
 
 
246 aa  118  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.36 
 
 
254 aa  118  9e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0245  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.864875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>