More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4291 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 262 aa  527  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0896711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.2 
 
 		 284 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 276 aa  168  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.05 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234758  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.41 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.768044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3723  D-mannonate oxidoreductase  38.85 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4190  D-mannonate oxidoreductase  36.76 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  36.64 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3914  D-mannonate oxidoreductase  37.77 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374414  normal  0.041983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 261 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0703  D-mannonate oxidoreductase  34.89 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  38.76 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  35.97 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  37.6 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  37.84 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  37.11 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 261 aa  155  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal  0.0404538 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  32.94 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.29 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  37.55 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  34.87 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  36.29 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 		 283 aa  152  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.9 
 
 		 255 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.55 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 263 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 255 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  35.57 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  35.27 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  36.82 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  37.01 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  36 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  37.01 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 261 aa  148  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.718128 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34118  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  34.78 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4747  gluconate 5-dehydrogenase  34.66 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  35.27 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  35.57 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04132  gluconate 5-dehydrogenase  34.66 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  37.01 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4522  gluconate 5-dehydrogenase  34.66 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0305607  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  34.68 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1598  D-mannonate oxidoreductase  33.46 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00242359  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04096  hypothetical protein  34.66 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2037  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00988022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  38.52 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  35.74 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2008  gluconate 5-dehydrogenase  36.33 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1695  gluconate 5-dehydrogenase  36.33 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.41 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  35.32 
 
 		 251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  33.07 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  36.51 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 		 283 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 260 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0981  2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase, putative  34.66 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0918  putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase  34.66 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.311873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  37.5 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 253 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0222  gluconate 5-dehydrogenase  33.47 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1909  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.25 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00371976  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 269 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2698  D-mannonate oxidoreductase  34.88 
 
 		 281 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>