More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2263 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 273 aa  547  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 		 270 aa  314  8e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4190  D-mannonate oxidoreductase  48.87 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203322  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3723  D-mannonate oxidoreductase  51.29 
 
 		 277 aa  280  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 284 aa  278  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.57 
 
 		 277 aa  267  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3914  D-mannonate oxidoreductase  50.92 
 
 		 277 aa  262  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374414  normal  0.041983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 		 274 aa  254  8e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0080  D-mannonate oxidoreductase  48.35 
 
 		 281 aa  238  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 274 aa  228  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.768044  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.66 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34118  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 		 283 aa  206  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2698  D-mannonate oxidoreductase  42.8 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0703  D-mannonate oxidoreductase  42.24 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1598  D-mannonate oxidoreductase  39.93 
 
 		 281 aa  191  8e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00242359  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0896711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.01 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  35.21 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 		 249 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.48 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 		 253 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 		 266 aa  131  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01588  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.33 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.444586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2331  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.33 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1806  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.33 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2011  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.33 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.617976  normal  0.65251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1694  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.33 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01578  hypothetical protein  32.33 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.777235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1580  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.33 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  35.36 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1827  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.33 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.96 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 		 255 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  33.71 
 
 		 256 aa  129  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000799282  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  32.23 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  35 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  32 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 253 aa  126  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00521448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.605713  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  34.59 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5273  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.58 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000251333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  32.71 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2902  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.08 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.773254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.59 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  34.09 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1576  gluconate 5-dehydrogenase  34.22 
 
 		 289 aa  122  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 		 253 aa  122  9e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 		 254 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 		 253 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.95 
 
 		 255 aa  122  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 		 259 aa  122  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 		 253 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 		 253 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4672  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  32.83 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 257 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>