More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4046 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.54 
 
 
283 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0703  D-mannonate oxidoreductase  62.09 
 
 
279 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.36 
 
 
274 aa  332  3e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1598  D-mannonate oxidoreductase  56.18 
 
 
281 aa  326  2.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00242359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2698  D-mannonate oxidoreductase  57.85 
 
 
281 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
274 aa  279  3e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.35 
 
 
273 aa  275  5e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3723  D-mannonate oxidoreductase  46.55 
 
 
277 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.95 
 
 
274 aa  243  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.768044  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.62 
 
 
276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.48 
 
 
277 aa  238  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234758  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
284 aa  234  8e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3914  D-mannonate oxidoreductase  44.14 
 
 
277 aa  228  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374414  normal  0.041983 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4190  D-mannonate oxidoreductase  43.68 
 
 
270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203322  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.23 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
270 aa  211  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0080  D-mannonate oxidoreductase  44.22 
 
 
281 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
273 aa  188  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
262 aa  143  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0896711  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
257 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
254 aa  142  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
263 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.07 
 
 
247 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.01 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.66 
 
 
255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.58 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  33.45 
 
 
260 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.35 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.41 
 
 
251 aa  129  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  33.21 
 
 
250 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04541  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  32.96 
 
 
250 aa  128  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0716484  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  32.97 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  32.85 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
253 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  30.99 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 
255 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_004310  BR1618  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.55 
 
 
255 aa  125  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.455189  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
257 aa  125  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
253 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
253 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.21 
 
 
252 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
253 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1561  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.55 
 
 
255 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  30.53 
 
 
301 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  29.82 
 
 
261 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  29.82 
 
 
261 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0146  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
277 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  31.85 
 
 
252 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 
260 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.25 
 
 
251 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  33.58 
 
 
256 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.25 
 
 
251 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 
252 aa  122  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2905  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.7 
 
 
292 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  29.93 
 
 
260 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  34.08 
 
 
252 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 
249 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00764889  hitchhiker  0.0046637 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
257 aa  122  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
246 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
269 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  30.26 
 
 
254 aa  122  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
256 aa  122  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000512545 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
276 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1576  gluconate 5-dehydrogenase  30.26 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  33.82 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  29.71 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5273  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.32 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  27.82 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 
266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.25 
 
 
255 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.99 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  34.06 
 
 
252 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1470  gluconate 5-dehydrogenase  29.89 
 
 
254 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  30.51 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0755029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.51 
 
 
244 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  33.94 
 
 
258 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  30.88 
 
 
255 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
255 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017919 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1671  Short-chain alcohol dehydrogenase  30 
 
 
260 aa  119  7.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.321944  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
263 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6325  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.37 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4264  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.55 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  30.51 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2584  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.61 
 
 
292 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
286 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>