More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1305 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
274 aa  559  1e-158  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1598  D-mannonate oxidoreductase  63.74 
 
 
281 aa  372  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00242359  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0703  D-mannonate oxidoreductase  64.21 
 
 
279 aa  358  4e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.36 
 
 
283 aa  332  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.18 
 
 
283 aa  325  6e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2698  D-mannonate oxidoreductase  56.32 
 
 
281 aa  292  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
274 aa  261  6e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.46 
 
 
273 aa  245  4.9999999999999997e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34118  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4190  D-mannonate oxidoreductase  42.34 
 
 
270 aa  217  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203322  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 
274 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.768044  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.03 
 
 
277 aa  215  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234758  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
284 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
276 aa  202  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3723  D-mannonate oxidoreductase  41.88 
 
 
277 aa  198  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3914  D-mannonate oxidoreductase  40.65 
 
 
277 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374414  normal  0.041983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0080  D-mannonate oxidoreductase  42.17 
 
 
281 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
270 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
273 aa  175  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
257 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  31.14 
 
 
258 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 
257 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 
262 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0896711  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  31.39 
 
 
260 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
276 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.36 
 
 
252 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  30.69 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  31.05 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  30.66 
 
 
258 aa  120  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  31.02 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000174886  normal  0.399546 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  32.48 
 
 
272 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  32.48 
 
 
272 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  30.22 
 
 
260 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3615  putative dehydrogenase  30.71 
 
 
291 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.427411  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.34 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  29.35 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.71 
 
 
255 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  30.69 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  31.29 
 
 
301 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 
248 aa  115  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  30.34 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  30.4 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 
245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.21 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.48 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 
263 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
254 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
251 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
276 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
253 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.22 
 
 
246 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  30.71 
 
 
255 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  31.5 
 
 
261 aa  112  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  30.11 
 
 
250 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  30.26 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.09 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  30.97 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1601  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786043  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  30.37 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  31.87 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  28.47 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04541  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  30.48 
 
 
250 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0716484  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  28.52 
 
 
255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.092297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.26 
 
 
247 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3915  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
255 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.73 
 
 
266 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
258 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  30.22 
 
 
254 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
246 aa  109  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  30.22 
 
 
254 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  29.85 
 
 
253 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  31.14 
 
 
258 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  29.85 
 
 
253 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  29.85 
 
 
253 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  29.89 
 
 
255 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>