More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5101 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5101  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 		 126 aa  253  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  49.02 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  47.62 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 167 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  47.78 
 
 		 172 aa  88.2  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1171  HxlR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0559  transcriptional regulator, HxlR family  45.26 
 
 		 149 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  48.89 
 
 		 177 aa  86.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1456  HxlR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2751  putative transcriptional regulator  45.92 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.992103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  48.28 
 
 		 193 aa  84.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 177 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6614  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  45.35 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2705  HxlR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2987  hypothetical protein  42.55 
 
 		 187 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2048  transcriptional regulator, HxlR family  45.88 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  43.48 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  43.82 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  44.76 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0996  transcriptional regulator, HxlR family  42.35 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 156 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  42.34 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  42.34 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  42.34 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  39.25 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  42.59 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0947  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135315  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  38.6 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5780  HxlR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  44.05 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  34.23 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0959  putative transcriptional regulator  52.11 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  43.02 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  41.05 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4941  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 295 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3271  HxlR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  35.96 
 
 		 157 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5249  HxlR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.222556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  36.56 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5484  HxlR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199529  normal  0.962234 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0785  transcriptional regulator, HxlR family  36.36 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  40.45 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  38.37 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5189  transcriptional regulator, HxlR family  42.53 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  42.7 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  41.18 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2057  transcriptional regulator, HxlR family  37.93 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.776461  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  44.83 
 
 		 160 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  40.7 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  40.7 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1847  putative transcriptional regulator  40.7 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  40.7 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  40.7 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  40.7 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  40.7 
 
 		 158 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4233  transcriptional regulator, HxlR family  37.08 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  41.86 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3272  transcriptional regulator, HxlR family  45.45 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1482  HxlR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1502  HxlR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  43.02 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  41.57 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1542  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000282269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>