91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4177 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4177  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  217  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4832  XRE family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 107 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5514  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1295  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  34.15 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3072  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0716873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4623  putative transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  36.21 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1649  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457933  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 219 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2999  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3106  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 201 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2125  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2112  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2171  XRE family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.864046  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  35 
 
 		 230 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  30.77 
 
 		 233 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3303  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 252 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  33.9 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23240  Helix-turn-helix protein  36.92 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0729263  normal  0.0373097 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2198  helix-turn-helix domain protein  36.36 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 		 283 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3407  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07210  Helix-turn-helix protein  38.46 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217016  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  28.42 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02050  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2028  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 181 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4371  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4437  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4285  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4256  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.949593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4325  XRE family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  0.293625 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1238  transcriptional regulator, XRE family  31.63 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3050  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0215158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  34.38 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17970  Helix-turn-helix protein  35 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162477  normal  0.719261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  34.38 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5702  transcriptional regulator, XRE family  28.81 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1098  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.380138  normal  0.0621931 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl455  Cro/CI family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.33845e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 200 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.49 
 
 		 188 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1647  helix-turn-helix domain protein  47.83 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.230686  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  38.3 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  38.3 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  38.3 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  38.3 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  38.3 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0428  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 197 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1365  hypothetical protein  35 
 
 		 477 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0285  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 74 aa  40  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.17528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  29.79 
 
 		 186 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 195 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 300 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 200 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5797  helix-turn-helix domain protein  36.51 
 
 		 138 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>