121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3661 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  100 
 
 
468 aa  930    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  50.59 
 
 
471 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  47.11 
 
 
473 aa  351  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  42.95 
 
 
466 aa  341  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  43.39 
 
 
469 aa  338  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  42.33 
 
 
472 aa  333  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  40.91 
 
 
481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  38.56 
 
 
477 aa  327  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  40.22 
 
 
468 aa  326  6e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  41.22 
 
 
481 aa  323  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  40.09 
 
 
467 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  41.08 
 
 
469 aa  323  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  39.7 
 
 
468 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  39.78 
 
 
468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  44.84 
 
 
471 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  43.95 
 
 
471 aa  317  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  41.75 
 
 
468 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  41.75 
 
 
468 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  40.91 
 
 
468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  41.51 
 
 
468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  44.17 
 
 
457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  40.22 
 
 
468 aa  293  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  42.36 
 
 
414 aa  290  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  39 
 
 
525 aa  277  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  37.9 
 
 
495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  32.53 
 
 
463 aa  226  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  36.04 
 
 
454 aa  220  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  33.33 
 
 
472 aa  216  9e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  32.37 
 
 
458 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  34.89 
 
 
460 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  31.69 
 
 
580 aa  199  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  29.56 
 
 
526 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  25.86 
 
 
525 aa  129  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  25.63 
 
 
497 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  23.57 
 
 
552 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  24.15 
 
 
539 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.81 
 
 
487 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  26.45 
 
 
544 aa  97.1  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  26.71 
 
 
440 aa  89  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2907  peptidase M28  29.68 
 
 
463 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3990  peptidase M28  25.54 
 
 
447 aa  82  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.558433  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  26.99 
 
 
578 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1360  peptidase M28  25.98 
 
 
454 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3109  protease-associated PA domain protein  24.75 
 
 
698 aa  69.7  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000536812  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  24.63 
 
 
456 aa  63.9  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3241  peptidase M28  28.09 
 
 
436 aa  63.9  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  26.17 
 
 
725 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  28.79 
 
 
512 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  26.3 
 
 
416 aa  61.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1664  peptidase M28  25.64 
 
 
479 aa  60.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3368  peptidase M28  24.94 
 
 
459 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  29.17 
 
 
677 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  34.11 
 
 
734 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  26.52 
 
 
534 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  32.89 
 
 
743 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  35.25 
 
 
757 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  29.47 
 
 
501 aa  57  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  31.62 
 
 
547 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  37.35 
 
 
775 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  31.85 
 
 
512 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  26.12 
 
 
488 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  29.74 
 
 
559 aa  55.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  42.03 
 
 
308 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  26.09 
 
 
434 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  30 
 
 
884 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  36.36 
 
 
751 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  23.04 
 
 
454 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  40 
 
 
483 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  41.1 
 
 
523 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  28.97 
 
 
503 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  32.04 
 
 
712 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  31.11 
 
 
575 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  24.78 
 
 
551 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0653  peptidase M28  22.14 
 
 
438 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.602384  normal  0.117412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  33.06 
 
 
551 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  33.1 
 
 
373 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05516  aminopeptidase  42.25 
 
 
504 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0487  putative leucine aminopeptidase  43.84 
 
 
408 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2124  aminopeptidase  43.84 
 
 
408 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0694  putative leucine aminopeptidase  43.84 
 
 
384 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.832714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0990  putative leucine aminopeptidase  43.84 
 
 
384 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33956  membrane protein involved in vacuolar protein sorting  41.84 
 
 
800 aa  51.2  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0845  peptidase family protein  43.84 
 
 
384 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.292004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0757  peptidase family protein  43.84 
 
 
408 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1962  putative leucine aminopeptidase  43.84 
 
 
384 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1155  peptidase M28  25.16 
 
 
462 aa  51.2  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.447711  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  43.21 
 
 
512 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5001  leucyl aminopeptidase  29.03 
 
 
417 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.341623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4476  leucyl aminopeptidase  29.03 
 
 
417 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  25.45 
 
 
568 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1852  leucine aminopeptidase, putative  42.47 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0188761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  25 
 
 
319 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  25.11 
 
 
518 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  31.63 
 
 
537 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  35.35 
 
 
550 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  30 
 
 
550 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  39.13 
 
 
335 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0596  aminopeptidase Ap1  43.84 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  26.13 
 
 
591 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3301  leucyl aminopeptidase  42.47 
 
 
417 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>