270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3179 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3179  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
187 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2235  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
184 aa  96.7  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0154013 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  33.33 
 
 
820 aa  71.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
269 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 
1276 aa  64.3  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 
649 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
425 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1631  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
299 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.863569  normal  0.0840181 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  28.7 
 
 
1240 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.73 
 
 
542 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
404 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
270 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.61 
 
 
219 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 
361 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 
371 aa  62.8  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.17 
 
 
746 aa  62.8  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 
391 aa  62.4  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.38 
 
 
462 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 
308 aa  61.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
357 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
1192 aa  60.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.12 
 
 
738 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  29.81 
 
 
581 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  29.01 
 
 
334 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 
593 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  31 
 
 
617 aa  59.3  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 
237 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  32.67 
 
 
233 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  32.04 
 
 
706 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  31.43 
 
 
306 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
349 aa  58.9  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.37 
 
 
706 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
187 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
266 aa  58.5  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
305 aa  58.2  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
605 aa  57.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
556 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
615 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
295 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
269 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32 
 
 
1022 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
4489 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
392 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
250 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 
3560 aa  57  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  29.51 
 
 
582 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.64 
 
 
406 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.64 
 
 
406 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
452 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  32.32 
 
 
539 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 
174 aa  56.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
699 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0055  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
166 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  32.69 
 
 
750 aa  55.8  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  32.32 
 
 
635 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
331 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 
319 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34 
 
 
988 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
591 aa  55.5  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
499 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.43 
 
 
289 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  34 
 
 
442 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
289 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 
784 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 
818 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
927 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
352 aa  54.3  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 
249 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1972  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 
301 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.23 
 
 
249 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1458  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 
410 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 
428 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 
1827 aa  53.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 
292 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0416  1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase  26.32 
 
 
541 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
1094 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 
295 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.84 
 
 
1056 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 
306 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  34 
 
 
292 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
279 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  30.61 
 
 
369 aa  52.8  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  31.63 
 
 
295 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 
356 aa  52.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
1276 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
376 aa  52.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.62 
 
 
373 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
731 aa  52.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 
446 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.08 
 
 
343 aa  52.4  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.71 
 
 
1056 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
711 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 
3035 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
422 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  33.01 
 
 
284 aa  51.6  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>