153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1709 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 407 aa  797    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  48.35 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  45.43 
 
 		 403 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5035  ABC-2 type transporter  44.78 
 
 		 402 aa  282  9e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  45.7 
 
 		 408 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3747  ABC-2 type transporter  45.5 
 
 		 403 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4131  ABC-2 type transporter  45.19 
 
 		 396 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.14 
 
 		 431 aa  189  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  31.51 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.2 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  24.42 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  20.69 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  24.07 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  23.57 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  20.7 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  23.66 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  24.38 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.57 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.56 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  24.48 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 367 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  20.9 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2372  hypothetical protein  25.51 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114721  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  26.86 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  28.17 
 
 		 356 aa  54.3  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  28.17 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  30.43 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  18.87 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 		 384 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  26.29 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 378 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  26.29 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  26.29 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  26.29 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 		 371 aa  53.9  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  26.29 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  26.29 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  31.25 
 
 		 383 aa  53.5  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  26.29 
 
 		 368 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.16 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  27.57 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1150  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.13202  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  26.29 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  27.78 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1040  ABC transporter, permease  24.16 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  26.29 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  26.29 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  26.29 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  30.46 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.22 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  24.43 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  24.43 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  24.86 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  20 
 
 		 365 aa  50.8  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  24.23 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2341  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.17 
 
 		 374 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 366 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 366 aa  50.4  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  23.25 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0811  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 		 375 aa  50.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  27.4 
 
 		 377 aa  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0138  ABC transporter, permease  26.32 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1308  ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2777  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.32 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2634  ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0164  ABC transporter, permease protein  26.32 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0920361  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 371 aa  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.78 
 
 		 257 aa  49.7  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  29.93 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 281 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0479  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 245 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 		 368 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1062  ABC-2 type transporter  23.76 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0758  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  19.02 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0437  ABC transporter, permease  25.88 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  26.22 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>