More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1667 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1667  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
305 aa  612  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3185  alpha/beta hydrolase fold  46.07 
 
 
296 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.460826  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0564  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0615  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 
308 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.494418 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1517  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 
275 aa  105  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2070  putative alpha/beta hydrolase fold precursor  29.26 
 
 
279 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  24.81 
 
 
268 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  22.99 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.365456  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  26.52 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  25 
 
 
261 aa  63.9  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  25.37 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  29.33 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  23.44 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  28.11 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
405 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
264 aa  60.1  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 
309 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  28.11 
 
 
397 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 
246 aa  59.7  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  24.9 
 
 
255 aa  59.3  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  22.09 
 
 
277 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.07 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  24.15 
 
 
259 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
254 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  25.96 
 
 
275 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  20.8 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  22.14 
 
 
259 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  22.35 
 
 
284 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 
340 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
261 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1625  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  36.04 
 
 
288 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.997053  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  20.22 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  23.72 
 
 
288 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  24.72 
 
 
266 aa  56.2  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  26.36 
 
 
264 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
264 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.84 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  22.14 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  26.2 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 
272 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5227  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 
233 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.968895  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  24.89 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.52 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2310  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
264 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2513  Alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3787  Alpha/beta hydrolase fold  23.22 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  26.49 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  34.74 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.01 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  20.58 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  23.22 
 
 
275 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.28 
 
 
263 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  22.22 
 
 
264 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.44 
 
 
311 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.61 
 
 
300 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.52 
 
 
282 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  19.57 
 
 
277 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0255  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 
258 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 
264 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  30.51 
 
 
264 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 
263 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  24.29 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  27.52 
 
 
300 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  23.81 
 
 
261 aa  53.1  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 
283 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 
273 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
295 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.13 
 
 
284 aa  52.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
297 aa  52.8  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  23.84 
 
 
265 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  25.22 
 
 
264 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 
273 aa  52.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  19.86 
 
 
270 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  21.97 
 
 
281 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
333 aa  52.4  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 
300 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  31.15 
 
 
264 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  19.86 
 
 
270 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  26.64 
 
 
256 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
322 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
300 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 
258 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>