More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1980 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1980  peroxiredoxin  100 
 
 		 221 aa  461  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0581  peroxiredoxin  82.65 
 
 		 224 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00103295  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2195  peroxiredoxin  81.28 
 
 		 224 aa  387  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0474553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1965  peroxiredoxin  79 
 
 		 225 aa  371  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1142  peroxiredoxin  75.23 
 
 		 225 aa  370  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0479  peroxiredoxin  78.44 
 
 		 223 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0011  peroxiredoxin  73.33 
 
 		 215 aa  334  7.999999999999999e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1416  peroxidase  65.73 
 
 		 220 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12960  Alkyl hydroperoxide reductase  66.19 
 
 		 216 aa  307  9e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000248971  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2393  Peroxiredoxin  64.73 
 
 		 213 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.843671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2560  3-Cys thioredoxin peroxidase / 1-Cys peroxiredoxin  64.9 
 
 		 215 aa  299  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1570  peroxidase  62.56 
 
 		 221 aa  295  5e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0271609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1379  Peroxiredoxin  63.64 
 
 		 213 aa  291  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.043311  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0119  peroxiredoxin  63.16 
 
 		 215 aa  291  4e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1445  peroxiredoxin  63.21 
 
 		 212 aa  291  5e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0121  peroxiredoxin  62.68 
 
 		 215 aa  290  8e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1196  peroxiredoxin  61.61 
 
 		 212 aa  288  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.136829  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0572  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  62.39 
 
 		 225 aa  285  5e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0207  putative peroxiredoxin  60.28 
 
 		 215 aa  277  8e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  60.28 
 
 		 220 aa  275  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00120067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2133  1-Cys peroxiredoxin, 3-Cys thioredoxin peroxidase  58.14 
 
 		 223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000419293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0326  peroxiredoxin  57.02 
 
 		 226 aa  266  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0883  Peroxiredoxin  58.8 
 
 		 213 aa  259  2e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000013318  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0396  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.54 
 
 		 216 aa  259  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.647366  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0492  peroxiredoxin  57.6 
 
 		 217 aa  257  9e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.081917  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1049  Peroxiredoxin  53.7 
 
 		 225 aa  252  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1496  peroxiredoxin  55.5 
 
 		 217 aa  248  4e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.583253  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0421  peroxiredoxin  54.84 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0972949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1762  peroxiredoxin  54.84 
 
 		 217 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.336606  normal  0.0393088 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1809  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.13 
 
 		 224 aa  244  6e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.420051  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0413  peroxiredoxin  55 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.695857  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2847  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55.56 
 
 		 215 aa  241  7e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1079  putative peroxiredoxin  51.66 
 
 		 230 aa  240  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0780  putative peroxiredoxin  49.07 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.467481  normal  0.867368 
 
 
-
 
NC_002936  DET1581  anti-oxidant AhpCTSA family protein  48.34 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000757986  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1330  3-Cys thioredoxin peroxidase  48.11 
 
 		 213 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00995589  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  46.58 
 
 		 213 aa  202  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0162  peroxidase  46.85 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0355  peroxiredoxin  43.81 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1056  Peroxiredoxin  46.98 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0479  peroxiredoxin  45.7 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.640513 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  46.01 
 
 		 220 aa  194  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  46.48 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1420  peroxiredoxin  44.64 
 
 		 240 aa  191  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3743  1-Cys peroxiredoxin  45.28 
 
 		 214 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1982  peroxidase  44.13 
 
 		 213 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0959  peroxiredoxin  42.79 
 
 		 228 aa  187  9e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.12414  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  44.29 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00098  alkyl hydroperoxide reductase  42.66 
 
 		 216 aa  184  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35496  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2522  putative peroxiredoxin  44.6 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0155428 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  46.2 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1920  peroxidase  42.45 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5317  antioxidant, AhpC/Tsa family  48.17 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1940  peroxiredoxin  41.86 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4877  peroxidase  48.17 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.885155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4325  1-Cys peroxiredoxin  47.12 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.269642 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0184  3-Cys thioredoxin peroxidase  45.45 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1677  putative antioxidant protein  44.5 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0938194  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4977  peroxidase  46.07 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000215393  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0235  peroxidase  45.55 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0250  peroxidase  45.55 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.024588  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19490  putative antioxidant protein  43.98 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0259  peroxidase  45.55 
 
 		 212 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0710  peroxidase  45.55 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0497094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  46.6 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  45.55 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  45.03 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1525  putative peroxiredoxin  38.54 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.89 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1860  peroxidase  41.86 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0693  peroxidase  45.55 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1388  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.03 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4218  Peroxidase  41.88 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4257  Peroxidase  41.88 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0781  peroxidase  45.03 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0812  peroxidase  45.03 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1262  peroxiredoxin  42.33 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.475702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0329  peroxidase  45.03 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0381  peroxidase  46.7 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.5059  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0397  Peroxidase  42.41 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5017  peroxidase  46.15 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2814  1-Cys peroxiredoxin  36.27 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2066  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.98 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3223  antioxidant protein LsfA  43.98 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3239  antioxidant protein LsfA  43.98 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2677  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.98 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.509603  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1932  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.98 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0844  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.98 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3186  antioxidant protein LsfA  43.98 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3905  peroxidase  44.5 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2571  peroxidase  45.03 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30530  peroxidase  43.46 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.898234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0754  antioxidant oxidoreductase protein  45.65 
 
 		 212 aa  154  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3838  peroxiredoxin  40.69 
 
 		 221 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3339  peroxidase  43.2 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0177487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0121  1-Cys peroxiredoxin  44.9 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  hitchhiker  0.000177221 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2312  peroxidase  45.56 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522236  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.91 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1358  1-Cys peroxiredoxin  44.57 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104768  normal  0.0118722 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1436  peroxidase  45.79 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00490504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>