148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1645 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1645  recombination regulator RecX  100 
 
 		 165 aa  340  7e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  52.87 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0427  recombination regulator RecX  44.37 
 
 		 159 aa  139  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.600852  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2007  recombination regulator RecX  40.88 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  41.36 
 
 		 178 aa  117  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  43.66 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1807  regulatory protein RecX  40 
 
 		 151 aa  93.2  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  31.03 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  30.88 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  30.5 
 
 		 253 aa  74.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  31.08 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0624  regulatory protein RecX  32.41 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.261265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4193  regulatory protein RecX  30.92 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1489  regulatory protein RecX  26.09 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  31.88 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1353  regulatory protein RecX  29.1 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  29.25 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  31.65 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3974  recombination regulator RecX  34.41 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1607  regulatory protein RecX  25.17 
 
 		 214 aa  61.2  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2198  putative regulatory protein RecX  32.8 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000131663  hitchhiker  0.0000324255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  28.85 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1654  recombination regulator RecX  34.11 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3631  regulatory protein RecX  34.09 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014201 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38550  recombination regulator RecX  32.89 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17540  recombination regulator RecX  33.11 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0842  recombination regulator RecX  29.45 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000969432  unclonable  0.0000000113027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  32.31 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  32.87 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12749  recombination regulator RecX  28.29 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000791448  normal  0.2039 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0854  recombination regulator RecX  34.38 
 
 		 222 aa  57.4  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3117  regulatory protein RecX  25.64 
 
 		 229 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000463252  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  30.53 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1216  regulatory protein RecX  32.39 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1524  recombination regulator RecX  33.1 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1786  regulatory protein RecX  30.07 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0677  regulatory protein RecX  23.49 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2421  recombination regulator RecX  33.71 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  0.0671144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  26.43 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3173  recombination regulator RecX  30.87 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0784826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  31.65 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  33.33 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1626  regulatory protein RecX  28.26 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0011722  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  27.34 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1176  recombination regulator RecX  31.69 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27810  hypothetical protein  26.57 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0393178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4684  regulatory protein RecX  29.87 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00211486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0997  recombination regulator RecX  26.92 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.297747  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3014  recombination regulator RecX  31.97 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170069  hitchhiker  0.000000000000467148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2961  regulatory protein RecX  27.86 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00629613  hitchhiker  0.0000594153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1232  recombination regulator RecX  33.82 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000982124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1630  recombination regulator RecX  32.35 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.993892  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1379  recombination regulator RecX  31.03 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  27.89 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1311  regulatory protein RecX  26.8 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.026843  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4087  recombination regulator RecX  32.35 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4029  recombination regulator RecX  32.35 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  hitchhiker  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1249  regulatory protein RecX  28 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.31343  unclonable  0.00000000000185024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0710  regulatory protein RecX  32.41 
 
 		 149 aa  50.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0925  regulatory protein RecX  29.66 
 
 		 150 aa  50.8  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2217  hypothetical protein  26.24 
 
 		 220 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002520  regulatory protein RecX  26.49 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1197  regulatory protein RecX  27.78 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3955  regulatory protein RecX  29.71 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  28.28 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  28.28 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  36.84 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0496  regulatory protein RecX  28.76 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3524  recombination regulator RecX  25.18 
 
 		 202 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0657793 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  29.86 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1288  regulatory protein RecX  29.58 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  28 
 
 		 220 aa  48.1  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0569  regulatory protein RecX  26.87 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.51496 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  29.17 
 
 		 225 aa  47.8  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0388  recX protein  31.58 
 
 		 138 aa  47.8  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1289  recX protein  34.09 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  29.01 
 
 		 207 aa  47.8  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1477  recombination regulator RecX  29.46 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.192923  normal  0.303181 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  22.14 
 
 		 222 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5194  regulatory protein RecX  28.57 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.910753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4032  recX protein  36.9 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1047  hypothetical protein  27.94 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.507009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1426  regulatory protein RecX  26.77 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.032748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1390  regulatory protein RecX  27.56 
 
 		 226 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0438385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3294  regulatory protein RecX  28.68 
 
 		 235 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.808849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0804  recombination regulator RecX  25.18 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237027  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03512  recombination regulator RecX  26.47 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1220  recombination regulator RecX  25.58 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  26.06 
 
 		 254 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  30.28 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  29.58 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0020  regulatory protein RecX  28.99 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  27 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3945  recombination regulator RecX  28.86 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220575  normal  0.609803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  24.81 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2982  recombination regulator RecX  28.86 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00147806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0651  recombination regulator RecX  30.28 
 
 		 285 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>