221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1138 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  100 
 
 
280 aa  577  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  54.64 
 
 
280 aa  317  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  58.78 
 
 
278 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  48.54 
 
 
284 aa  277  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  42.07 
 
 
285 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  41.06 
 
 
282 aa  195  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  36.13 
 
 
287 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  38.83 
 
 
284 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  38.41 
 
 
286 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  40.96 
 
 
281 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 
284 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  40.07 
 
 
283 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  35.16 
 
 
279 aa  178  8e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  36.47 
 
 
280 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  37.13 
 
 
284 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  34.07 
 
 
279 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  33.46 
 
 
285 aa  168  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  37.18 
 
 
282 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  35.53 
 
 
287 aa  166  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  32.13 
 
 
284 aa  159  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  32.08 
 
 
302 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  31.44 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 
284 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 
284 aa  152  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  31.44 
 
 
284 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  31.44 
 
 
284 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  31.44 
 
 
284 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  31.44 
 
 
284 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  36.92 
 
 
288 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  31.32 
 
 
284 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  31.06 
 
 
284 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  30.57 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  36.68 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  36.67 
 
 
288 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  36.67 
 
 
288 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 
282 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  31.34 
 
 
287 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2004  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.867413  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  26.24 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0553  putative Zn-dependent hydrolase  27 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.499931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0189  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0949423  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3256  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3682  beta-lactamase domain protein  23.81 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  22.59 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  26.28 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  25.33 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 
282 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  26.34 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  27.88 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.47 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  25.61 
 
 
282 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  22.71 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  24.65 
 
 
319 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  24.31 
 
 
310 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 
310 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  23.61 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  24.79 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 
301 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  25.69 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  25.68 
 
 
291 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  22.42 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  22.36 
 
 
297 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  28.93 
 
 
271 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3218  beta-lactamase domain-containing protein  25.88 
 
 
297 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695315  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5790  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  22.46 
 
 
311 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  24.65 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  25.43 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  24.31 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  23.04 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  26.27 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1508  Beta-lactamase-like  22.76 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0967  putative Zn-dependent hydrolase  24.89 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674922  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  23.39 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3466  beta-lactamase domain protein  26.47 
 
 
314 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  23.39 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2976  beta-lactamase domain-containing protein  30.28 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5276  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 
286 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.872928  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  21.9 
 
 
306 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  27.45 
 
 
315 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0446  beta-lactamase domain-containing protein  25.16 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.596679  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0379  metallo-beta-lactamase family protein  25.16 
 
 
270 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.775533  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  25.23 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  27.45 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  23.81 
 
 
304 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  25.46 
 
 
311 aa  55.8  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  23.18 
 
 
317 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  23.98 
 
 
306 aa  55.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1218  hypothetical protein  24.36 
 
 
275 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.404432  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.93 
 
 
266 aa  55.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  21.88 
 
 
305 aa  55.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>