More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8637 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
370 aa  746    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2119  alpha/beta hydrolase fold  59.04 
 
 
307 aa  342  7e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  53.99 
 
 
281 aa  323  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  30.18 
 
 
320 aa  142  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 
291 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  32.6 
 
 
324 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
335 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
290 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.34 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
287 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.81 
 
 
341 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
283 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
291 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  25.47 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 
348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
340 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
321 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 
282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  26.65 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 
335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 
291 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 
291 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  26.78 
 
 
262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
351 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
297 aa  105  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  27.99 
 
 
294 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24.36 
 
 
289 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  24.36 
 
 
289 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
292 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  25.82 
 
 
302 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  28.99 
 
 
346 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 
278 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  28.44 
 
 
312 aa  99.4  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  27.16 
 
 
278 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.24 
 
 
291 aa  96.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
298 aa  96.3  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 
284 aa  95.9  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  26.63 
 
 
288 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 
284 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 
287 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  23.03 
 
 
287 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  26.93 
 
 
309 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 
298 aa  89.7  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 
286 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  23.15 
 
 
290 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.01 
 
 
293 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  24.85 
 
 
302 aa  86.3  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  25.16 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  25.07 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  23.62 
 
 
319 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  23.96 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 
302 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 
294 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  23.2 
 
 
317 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
275 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  25.22 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  26.2 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  23.64 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  23.7 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  26.22 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  26.59 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  22.19 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0771  alpha/beta hydrolase fold protein  27.79 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 
314 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  27.81 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  21.85 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  27.27 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  22.54 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  26.23 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.67 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  28 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  28 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>