116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7730 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7730  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1943  Methyltransferase type 12  53.9 
 
 		 268 aa  285  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2199  Methyltransferase type 11  45.9 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7163  methyltransferase type 12  44.24 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0716695  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0150  putative SAM-dependent methyltransferase  42.44 
 
 		 263 aa  205  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  39.64 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1604  methyltransferase type 12  42.03 
 
 		 276 aa  201  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  40 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4214  methyltransferase type 12  40.38 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0141  methyltransferase type 12  40.38 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4368  methyltransferase type 12  39.93 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0145  methyltransferase type 12  40 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.748681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0144  Methyltransferase type 12  40 
 
 		 255 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0142  methyltransferase type 12  40.38 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2394  methyltransferase type 11  42.26 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.437814  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0139  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0151  SAM-dependent methyltransferase  38.87 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0144  methyltransferase type 12  40 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3108  methyltransferase type 12  38.49 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0139  methyltransferase type 12  39.62 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  38.32 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3561  methyltransferase type 12  40 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  0.312101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1908  methyltransferase type 12  39.03 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3927  methyltransferase type 12  39.03 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0136  methyltransferase type 12  36.23 
 
 		 267 aa  178  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0500075  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2238  methyltransferase type 12  36.57 
 
 		 261 aa  176  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2218  Methyltransferase type 12  40.83 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0336  hypothetical protein  37.4 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  38.99 
 
 		 278 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1928  Methyltransferase type 12  41.16 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0327812  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2116  Methyltransferase type 12  36.23 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0427  Methyltransferase type 12  39.48 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.919654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  37.41 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3729  hypothetical protein  35.58 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.844109  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  34.04 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1229  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  33.68 
 
 		 283 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  36.11 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2574  methyltransferase type 12  33.57 
 
 		 281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2006  hypothetical protein  32.78 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3834  methyltransferase type 11  32.03 
 
 		 269 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63410  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2320  hypothetical protein  28.44 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2634  hypothetical protein  27.78 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15810  methyltransferase family protein  32.45 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.104382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0830  hypothetical protein  38.1 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0563869  unclonable  0.0000109748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2299  methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  29.18 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.12 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  30.37 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  27.8 
 
 		 276 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4904  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5279  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  30.74 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5178  hypothetical protein  27.62 
 
 		 272 aa  52  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0583727  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4748  methyltransferase  28.02 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5184  hypothetical protein  26.37 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  26.37 
 
 		 272 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  26.79 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 299 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.92 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4767  methyltransferase  27.47 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5148  hypothetical protein  27.47 
 
 		 272 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.067424 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29830  putative methyltransferase  25.4 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00181323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  25.94 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 268 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2556  methyltransferase  25 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5193  hypothetical protein  24.04 
 
 		 272 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.78 
 
 		 282 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4863  methyltransferase type 11  24.46 
 
 		 272 aa  45.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1918  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.94 
 
 		 236 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00158805  hitchhiker  0.0000000749006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2413  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.5 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1971  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.22 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000321939  hitchhiker  0.00000717465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3875  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.48 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.04 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  25 
 
 		 207 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.48 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.48 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.48 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2083  methyltransferase small  38.96 
 
 		 204 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  32.48 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.48 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>