More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6248 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6248  NLP/P60 protein  100 
 
 		 285 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0809629  normal  0.153407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2622  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.37 
 
 		 203 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.32 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.34 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  28.7 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2670  NLP/P60 protein  33.8 
 
 		 818 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  53.97 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.67 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  43.16 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2826  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.03 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  43.16 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  43.16 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  60 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  40.57 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1654  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.52 
 
 		 974 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00486103  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  34.33 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  40.96 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  40.96 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  40.96 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  40.96 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  42.17 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  40.96 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  40.96 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  40.96 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5739  NLP/P60 protein  38.38 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5540  NLP/P60 protein  39.77 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.981915  normal  0.121534 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.38 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5736  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  54.72 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  42.17 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.62 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  42.17 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  34.32 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  40.24 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  40.2 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0234  hypothetical protein  42.86 
 
 		 403 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  39.76 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1440  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  31.85 
 
 		 517 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  38.55 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  38.55 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  38.55 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4557  NLP/P60 protein  32.61 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  40 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  32.39 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  40.45 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  39.76 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  39.76 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  40.74 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  40.45 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.54 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  33.33 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  38.95 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  25.97 
 
 		 450 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  32.34 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5534  NLP/P60 protein  38.67 
 
 		 420 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.96 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  37.8 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6528  NLP/P60 protein  34.34 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.203343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  33.05 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  45.57 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  39.76 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  33.05 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4629  NLP/P60 protein  35.16 
 
 		 411 aa  55.8  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  34.57 
 
 		 466 aa  55.8  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  36.96 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  34.09 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  43.06 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.83 
 
 		 629 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  41.76 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  37.62 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  23.9 
 
 		 454 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  46.15 
 
 		 2277 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.17 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  44.3 
 
 		 432 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.15 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0267  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.46 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4988  NLP/P60 protein  38.95 
 
 		 448 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.31 
 
 		 182 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0085  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 143 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1447  NLP/P60  31.74 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.397182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 225 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1465  NLP/P60 protein  31.74 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  52.08 
 
 		 462 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  39.77 
 
 		 180 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.17 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  36.26 
 
 		 192 aa  53.1  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>