More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5754 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 348 aa  684    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  54.27 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  50.6 
 
 		 347 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4620  transcriptional regulator, LacI family  45.99 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1691  transcriptional regulator, LacI family  49.4 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0314799  normal  0.084893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  47.13 
 
 		 347 aa  269  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0995  transcriptional regulator, LacI family  50.9 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2567  transcriptional regulator, LacI family  48.09 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.789697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  42.86 
 
 		 349 aa  246  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2664  transcriptional regulator, LacI family  43.06 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3259  alanine racemase  44.31 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884845  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1432  transcriptional regulator, LacI family  45.09 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  41.59 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3489  LacI family transcription regulator  42.94 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0487492 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  41.23 
 
 		 354 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3975  transcriptional regulator, LacI family  42.46 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00653549  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  41.59 
 
 		 353 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.62 
 
 		 352 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  39.51 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5028  transcriptional regulator, LacI family  41.19 
 
 		 348 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108824  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 		 342 aa  202  8e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3961  transcriptional regulator, LacI family  39.76 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0946705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4767  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  38.55 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  38.53 
 
 		 365 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.84 
 
 		 338 aa  195  8.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  36.12 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2013  transcriptional regulator, LacI family  42.43 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 		 340 aa  189  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2268  transcriptional regulator, LacI family  39.68 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3595  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.94 
 
 		 356 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.199823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.77 
 
 		 353 aa  186  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3964  transcriptional regulator, LacI family  40.43 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147565  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  34.86 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  35.12 
 
 		 357 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.66 
 
 		 332 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  38.15 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  34.82 
 
 		 368 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  34.04 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  35.58 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.25 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.31 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.31 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  34.31 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.71 
 
 		 336 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 		 343 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  36.06 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4247  alanine racemase  39.34 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.645123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.01 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  34.93 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  33.64 
 
 		 340 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  33.64 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.47 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  33.64 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3559  transcriptional regulator, LacI family  36.17 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  33.84 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  34.56 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  33.64 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  31.12 
 
 		 342 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 340 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.05 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  33.84 
 
 		 334 aa  169  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.13 
 
 		 346 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  34.88 
 
 		 346 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2056  LacI family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 344 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.727085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  34.69 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  34.69 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.45 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  34.69 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  34.69 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  32.62 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  30.28 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  34.46 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 		 358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  30.89 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  32.53 
 
 		 340 aa  165  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  29.31 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  36.5 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.36 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  28.7 
 
 		 339 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  30.28 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  30.28 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  30.58 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  30.58 
 
 		 332 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  34.33 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  35.48 
 
 		 357 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>