More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5216 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 		 152 aa  306  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  54.17 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  54.17 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  54.17 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  54.17 
 
 		 154 aa  160  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  54.17 
 
 		 178 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  54.17 
 
 		 244 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  52.38 
 
 		 148 aa  157  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  60.48 
 
 		 268 aa  157  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  54.74 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 149 aa  153  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  56.15 
 
 		 148 aa  153  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 147 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 156 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  52.11 
 
 		 163 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  52.11 
 
 		 163 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 172 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 172 aa  148  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 147 aa  146  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  51.13 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  52.27 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  48.55 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  53.79 
 
 		 135 aa  143  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  51.52 
 
 		 166 aa  142  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  45.77 
 
 		 146 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 154 aa  140  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  45.07 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  56.69 
 
 		 150 aa  137  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  53.54 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  47.92 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  46 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  46.48 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 179 aa  130  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  45.19 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 156 aa  106  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  45 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  48 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  40.3 
 
 		 177 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  41.04 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  39.47 
 
 		 188 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  48.94 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  52.04 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  40.6 
 
 		 177 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  38.52 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  47.71 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  41.04 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  39.37 
 
 		 193 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  34.97 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3961  transcriptional regulator, HxlR family  40.6 
 
 		 183 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00918513  normal  0.0163124 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3847  transcriptional regulator, HxlR family  40.6 
 
 		 183 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000228408  normal  0.91917 
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  40.97 
 
 		 183 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  34.27 
 
 		 157 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  38.84 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  36.57 
 
 		 172 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 171 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1362  transcriptional regulator, HxlR family  38.73 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.941236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  38.85 
 
 		 209 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0541  hypothetical protein  31.85 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000782637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  37.8 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  44.14 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  39.69 
 
 		 171 aa  90.9  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  37.59 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  36.5 
 
 		 290 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2369  transcriptional regulator, HxlR family  36.89 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 172 aa  87.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1106  HxlR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 162 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1043  transcriptional regulator, HxlR family  38.61 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247378  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1586  HxlR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 162 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1269  HxlR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 318 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.178567  decreased coverage  0.00270462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  42.71 
 
 		 212 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  39.42 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2008  HxlR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  35.11 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  35.11 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>