More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0179 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0179  signal peptidase I  100 
 
 		 342 aa  697    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  40.08 
 
 		 469 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  39.13 
 
 		 266 aa  149  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1517  signal peptidase I  39.81 
 
 		 298 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal  0.0166712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3254  signal peptidase I  39.27 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23700  signal peptidase I  36.78 
 
 		 279 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.412828  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0990  signal peptidase I  40.98 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000142727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1172  signal peptidase I  43.38 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1475  signal peptidase I  40 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.393591  normal  0.0414721 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1404  signal peptidase I  43.01 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.012571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2890  signal peptidase I  42.93 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527092  normal  0.396669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2477  signal peptidase I  34.17 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0881706  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4169  signal peptidase I  34.48 
 
 		 284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2217  signal peptidase I  38 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000553626 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11110  signal peptidase I  37.8 
 
 		 268 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056722  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  37.96 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09800  signal peptidase I  33.61 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1951  signal peptidase I  35.93 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1971  signal peptidase I  35.93 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0145685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2017  signal peptidase I  35.93 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  37.04 
 
 		 216 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2193  signal peptidase I  34.96 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.107001  normal  0.241649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0229  signal peptidase I  33.92 
 
 		 291 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  36.41 
 
 		 360 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  36.48 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1023  signal peptidase I  39.06 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.114866  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2187  signal peptidase I  38.5 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1200  signal peptidase I  34.76 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5921  signal peptidase I  34.88 
 
 		 288 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0282682  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1311  signal peptidase I  34.29 
 
 		 213 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4002  signal peptidase I  35.92 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4540  signal peptidase I  39.78 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0613872  normal  0.498524 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2535  signal peptidase I  40.21 
 
 		 247 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.317865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3131  signal peptidase I  36.28 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000239425  normal  0.113898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  35.45 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  35.65 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1832  Signal peptidase I-like protein  34.82 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  34.09 
 
 		 290 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2186  signal peptidase I  34.51 
 
 		 304 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  35.35 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0349  signal peptidase I  35.04 
 
 		 262 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  35.21 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  38.29 
 
 		 215 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  34.87 
 
 		 192 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9015  Signal peptidase I-like protein  34.22 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  34.87 
 
 		 193 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1631  signal peptidase I  33.04 
 
 		 288 aa  93.6  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  32.75 
 
 		 190 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  32.64 
 
 		 209 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  31.68 
 
 		 184 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2188  signal peptidase I  37.74 
 
 		 230 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0349531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2091  signal peptidase I  33.03 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  33.33 
 
 		 190 aa  87  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  36.67 
 
 		 173 aa  86.7  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1383  signal peptidase I  31.66 
 
 		 188 aa  86.7  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00010466  normal  0.416306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  35.38 
 
 		 214 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  34.33 
 
 		 208 aa  86.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1153  signal peptidase I  34.86 
 
 		 434 aa  85.9  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.573938  normal  0.0315154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  33.98 
 
 		 197 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  32.04 
 
 		 198 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  31.31 
 
 		 187 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  30.99 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2816  signal peptidase I  35.75 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  31.42 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  34.52 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  34.52 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  34.01 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05490  signal peptidase I  31.67 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  31.46 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  31.96 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1833  signal peptidase I  31.63 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  33.33 
 
 		 189 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2218  signal peptidase I  30.14 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000177112 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  35.05 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  35.05 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09200  signal peptidase I  35.33 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.537704  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3589  signal peptidase I  33.6 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1382  signal peptidase I  31.69 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000813945  normal  0.891342 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0073  signal peptidase I  28.87 
 
 		 183 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  32.99 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  31.78 
 
 		 215 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  31.79 
 
 		 174 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  32.66 
 
 		 171 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0692  signal peptidase I  32.1 
 
 		 184 aa  78.6  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0204577  hitchhiker  0.0000207144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2478  signal peptidase I  34.05 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0470838  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2249  signal peptidase I  33.15 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1403  signal peptidase I  33.33 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.880656  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09210  signal peptidase I  34.55 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0732618  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  32.21 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2049  signal peptidase I  30.53 
 
 		 185 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000784744  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11010  signal peptidase I  32.61 
 
 		 189 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0396418  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05151  Signal peptidase I  27.52 
 
 		 238 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.715932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2260  signal peptidase I  32.83 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  32.78 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2873  signal peptidase I  27.64 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125628 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  29.86 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  29.67 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1150  signal peptidase I  28.31 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1447  signal peptidase I  27.42 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0199  signal peptidase I  28.76 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>