More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4624 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  100 
 
 		 574 aa  1155    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  43.08 
 
 		 559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01599  putative Voltage-gated ClC-type chloride channel clcA  43.8 
 
 		 538 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2817  Cl- channel, voltage gated  35.51 
 
 		 574 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  36.3 
 
 		 585 aa  289  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1201  chloride channel core  35.15 
 
 		 575 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2978  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.96 
 
 		 574 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0983  chloride channel core  35.74 
 
 		 573 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20295  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1121  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.4 
 
 		 574 aa  269  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1302  chloride channel  36.51 
 
 		 574 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1161  chloride channel core  36.14 
 
 		 574 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.541504  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1206  chloride channel core  36.14 
 
 		 574 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3151  Chloride channel core  36.14 
 
 		 574 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1239  chloride channel core  35.96 
 
 		 574 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2891  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.68 
 
 		 574 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0598145  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2973  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.68 
 
 		 574 aa  252  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000658505 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3069  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.68 
 
 		 574 aa  252  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.724246  hitchhiker  0.00000035598 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0841  chloride channel  36.33 
 
 		 571 aa  249  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.690246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1093  Cl-channel, voltage-gated family protein  35.61 
 
 		 569 aa  249  8e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00228292  decreased coverage  0.00554461 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.35 
 
 		 575 aa  249  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  32.29 
 
 		 585 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  32.69 
 
 		 604 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.78 
 
 		 591 aa  243  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1015  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.88 
 
 		 569 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.411818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  36.16 
 
 		 575 aa  223  8e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  34.68 
 
 		 579 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  29.27 
 
 		 608 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  25.7 
 
 		 613 aa  159  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  29.25 
 
 		 519 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  29.25 
 
 		 519 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  26.57 
 
 		 614 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.54 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.54 
 
 		 636 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.54 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.54 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  30.33 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.4 
 
 		 526 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  32.54 
 
 		 512 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.21 
 
 		 580 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.85 
 
 		 582 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.56 
 
 		 628 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  28.95 
 
 		 626 aa  144  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.56 
 
 		 587 aa  144  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.37 
 
 		 589 aa  143  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.89 
 
 		 589 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.68 
 
 		 593 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.12 
 
 		 589 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  33.12 
 
 		 523 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  32.8 
 
 		 523 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.12 
 
 		 589 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.68 
 
 		 593 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  28.42 
 
 		 569 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.17 
 
 		 598 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  26.74 
 
 		 510 aa  136  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.26 
 
 		 615 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  28.76 
 
 		 464 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  28.76 
 
 		 464 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  31.82 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.06 
 
 		 591 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  27.97 
 
 		 600 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.6 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.91 
 
 		 606 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2049  Chloride channel core  26.27 
 
 		 596 aa  131  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.993111  normal  0.527331 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.67 
 
 		 754 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.88 
 
 		 577 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  27.71 
 
 		 669 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  26.71 
 
 		 627 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.39 
 
 		 591 aa  126  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.16 
 
 		 591 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  27.19 
 
 		 538 aa  126  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  28.31 
 
 		 584 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.89 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  30.66 
 
 		 863 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  28.15 
 
 		 528 aa  125  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  30.81 
 
 		 462 aa  125  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  30.89 
 
 		 598 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  28.16 
 
 		 859 aa  124  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  28.51 
 
 		 510 aa  124  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1534  Cl- channel, voltage gated  31.49 
 
 		 527 aa  123  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.123029  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  27.38 
 
 		 631 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.02 
 
 		 594 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  28.38 
 
 		 543 aa  121  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  29.27 
 
 		 518 aa  120  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  28.21 
 
 		 603 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  26.07 
 
 		 577 aa  120  7e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  31.93 
 
 		 586 aa  120  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  28.49 
 
 		 604 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  32.1 
 
 		 512 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  27.61 
 
 		 624 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4701  Chloride channel core  28.41 
 
 		 471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.10029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  28.34 
 
 		 613 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.26 
 
 		 565 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  28.05 
 
 		 602 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  25.41 
 
 		 473 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  25.41 
 
 		 473 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  25.41 
 
 		 473 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  25.41 
 
 		 473 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.29 
 
 		 620 aa  117  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  25.89 
 
 		 471 aa  117  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  29.46 
 
 		 516 aa  116  8.999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>