More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1239 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1302  chloride channel  93.37 
 
 
574 aa  989    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1239  chloride channel core  100 
 
 
574 aa  1154    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1093  Cl-channel, voltage-gated family protein  74.77 
 
 
569 aa  738    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00228292  decreased coverage  0.00554461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1201  chloride channel core  74.19 
 
 
575 aa  778    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000459194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1161  chloride channel core  99.83 
 
 
574 aa  1152    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.541504  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1015  Cl- channel, voltage-gated family protein  74.35 
 
 
569 aa  756    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.411818  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1121  Cl- channel, voltage-gated family protein  94.95 
 
 
574 aa  1001    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2817  Cl- channel, voltage gated  77.84 
 
 
574 aa  855    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2891  Cl- channel, voltage-gated family protein  94.07 
 
 
574 aa  976    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0598145  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2973  Cl- channel, voltage-gated family protein  94.24 
 
 
574 aa  978    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000658505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2978  Cl- channel, voltage-gated family protein  78.88 
 
 
574 aa  854    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3151  Chloride channel core  99.65 
 
 
574 aa  1149    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0983  chloride channel core  75.31 
 
 
573 aa  801    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20295  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1206  chloride channel core  99.83 
 
 
574 aa  1152    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3069  Cl- channel, voltage-gated family protein  94.24 
 
 
574 aa  978    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.724246  hitchhiker  0.00000035598 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0841  chloride channel  79.53 
 
 
571 aa  779    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.690246 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  40.9 
 
 
559 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01599  putative Voltage-gated ClC-type chloride channel clcA  38.29 
 
 
538 aa  318  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  35.96 
 
 
574 aa  291  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  38.12 
 
 
575 aa  266  7e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.35 
 
 
591 aa  257  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  32.61 
 
 
585 aa  256  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  32.06 
 
 
585 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  34.61 
 
 
579 aa  228  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  33.21 
 
 
604 aa  219  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  33.22 
 
 
575 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.85 
 
 
582 aa  177  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  28.02 
 
 
613 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  27.97 
 
 
614 aa  156  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.27 
 
 
519 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  30.43 
 
 
608 aa  137  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.03 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.09 
 
 
587 aa  134  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  29.97 
 
 
669 aa  134  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  28.76 
 
 
577 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  30.54 
 
 
584 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  31.01 
 
 
600 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.75 
 
 
565 aa  131  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.84 
 
 
591 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  28.8 
 
 
473 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  28.8 
 
 
473 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  28.8 
 
 
473 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.68 
 
 
470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  28.93 
 
 
569 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  27.15 
 
 
633 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  28.25 
 
 
473 aa  127  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  26.65 
 
 
615 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  28.48 
 
 
473 aa  127  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  27.03 
 
 
627 aa  126  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.07 
 
 
466 aa  126  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  28.78 
 
 
471 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.08 
 
 
560 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.03 
 
 
598 aa  124  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  28.72 
 
 
598 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  31.34 
 
 
626 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  28.95 
 
 
613 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.23 
 
 
606 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  28.3 
 
 
543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  28.91 
 
 
512 aa  118  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.9 
 
 
439 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  26.9 
 
 
439 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.9 
 
 
439 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  27.04 
 
 
627 aa  117  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  27.65 
 
 
631 aa  117  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.65 
 
 
589 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  26.3 
 
 
562 aa  116  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  28.41 
 
 
629 aa  116  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  26.95 
 
 
538 aa  115  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  28.13 
 
 
605 aa  115  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  28.71 
 
 
510 aa  113  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  26.44 
 
 
603 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  25.86 
 
 
604 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.93 
 
 
593 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  27.44 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  27.44 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  27.44 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.45 
 
 
589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  27.61 
 
 
563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.7 
 
 
589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.7 
 
 
589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  26.03 
 
 
602 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.93 
 
 
593 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  24.36 
 
 
479 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  28.4 
 
 
533 aa  110  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  24.74 
 
 
600 aa  110  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.46 
 
 
577 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  29.7 
 
 
628 aa  110  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.85 
 
 
620 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  23.44 
 
 
594 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  26.62 
 
 
528 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  26.44 
 
 
624 aa  108  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.52 
 
 
628 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.35 
 
 
591 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2285  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.46 
 
 
426 aa  107  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397915  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  29.57 
 
 
586 aa  107  8e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1867  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.68 
 
 
414 aa  107  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.396231  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  26.7 
 
 
595 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1979  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.68 
 
 
426 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  29.22 
 
 
593 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  29.89 
 
 
457 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>