More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1015 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1093  Cl-channel, voltage-gated family protein  75.04 
 
 		 569 aa  757    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00228292  decreased coverage  0.00554461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1201  chloride channel core  75.62 
 
 		 575 aa  820    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459194 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1302  chloride channel  74.74 
 
 		 574 aa  773    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1015  Cl- channel, voltage-gated family protein  100 
 
 		 569 aa  1147    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.411818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1239  chloride channel core  74.35 
 
 		 574 aa  763    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.675776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3151  Chloride channel core  74.35 
 
 		 574 aa  763    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1161  chloride channel core  74.35 
 
 		 574 aa  763    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.541504  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0983  chloride channel core  74.69 
 
 		 573 aa  812    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20295  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1121  Cl- channel, voltage-gated family protein  73.54 
 
 		 574 aa  762    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2817  Cl- channel, voltage gated  69.69 
 
 		 574 aa  772    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1206  chloride channel core  74.35 
 
 		 574 aa  763    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2891  Cl- channel, voltage-gated family protein  74.91 
 
 		 574 aa  756    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0598145  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2973  Cl- channel, voltage-gated family protein  74.91 
 
 		 574 aa  756    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000658505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2978  Cl- channel, voltage-gated family protein  69.16 
 
 		 574 aa  750    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3069  Cl- channel, voltage-gated family protein  74.91 
 
 		 574 aa  756    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.724246  hitchhiker  0.00000035598 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0841  chloride channel  70.83 
 
 		 571 aa  705    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.690246 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  40.51 
 
 		 559 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01599  putative Voltage-gated ClC-type chloride channel clcA  38.42 
 
 		 538 aa  333  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4624  voltage-gated chloride channel  34.57 
 
 		 574 aa  280  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  37.77 
 
 		 575 aa  259  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  35.6 
 
 		 591 aa  257  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  30.83 
 
 		 585 aa  243  7.999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  37.08 
 
 		 579 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3300  Cl- channel, voltage gated  32.16 
 
 		 585 aa  224  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0616826  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2144  Cl- channel voltage-gated family protein  31.16 
 
 		 604 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0358  Cl- channel, voltage gated  31.5 
 
 		 575 aa  213  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.44 
 
 		 582 aa  182  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  26.72 
 
 		 613 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  26.89 
 
 		 614 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  28.8 
 
 		 577 aa  150  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.58 
 
 		 598 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  25.46 
 
 		 519 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.07 
 
 		 587 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  26.24 
 
 		 627 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  28.53 
 
 		 569 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  29.21 
 
 		 608 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  25.58 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  27.42 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  27.37 
 
 		 615 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  29.75 
 
 		 631 aa  130  9.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  27.24 
 
 		 584 aa  130  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.84 
 
 		 589 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.65 
 
 		 589 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  29.1 
 
 		 512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.37 
 
 		 589 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.37 
 
 		 589 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  27.23 
 
 		 627 aa  127  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  30.26 
 
 		 626 aa  127  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  28.35 
 
 		 473 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  28.35 
 
 		 473 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  28.35 
 
 		 473 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  28.35 
 
 		 473 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  27.62 
 
 		 606 aa  126  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  28.35 
 
 		 473 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.99 
 
 		 591 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.54 
 
 		 593 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2054  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.75 
 
 		 565 aa  124  6e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.71 
 
 		 439 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.71 
 
 		 439 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  26.71 
 
 		 439 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  29.5 
 
 		 560 aa  123  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  29.49 
 
 		 538 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.26 
 
 		 593 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  28.44 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.39 
 
 		 591 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  28.81 
 
 		 600 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  27.86 
 
 		 466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  28.16 
 
 		 602 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  27.75 
 
 		 628 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0367  Chloride channel core  25.32 
 
 		 595 aa  117  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  26.28 
 
 		 528 aa  117  7.999999999999999e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  27.31 
 
 		 669 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  27.1 
 
 		 533 aa  116  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.39 
 
 		 577 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.84 
 
 		 628 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.08 
 
 		 620 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  27.92 
 
 		 563 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.11 
 
 		 579 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.11 
 
 		 579 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.11 
 
 		 579 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  26.26 
 
 		 624 aa  114  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.11 
 
 		 636 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  26.81 
 
 		 613 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  24.44 
 
 		 633 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  27.48 
 
 		 605 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2412  putative chloride channel protein  25.34 
 
 		 562 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  25.61 
 
 		 598 aa  113  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  28.44 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  28.44 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  28.43 
 
 		 510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  28.44 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  28.44 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.89 
 
 		 591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  28.16 
 
 		 455 aa  111  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  27.22 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  27.22 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  27.87 
 
 		 539 aa  110  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  28.52 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2746  Cl- channel, voltage gated  26.32 
 
 		 543 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.43501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  26 
 
 		 859 aa  109  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>